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NBDC ヒトデータベース
JGAD000086
公開日
2020-09-28

更新日
2020-09-28

研究
hum0133

データの種類
NGS(Exome)

アクセス制限
制限公開(Type I)

JGA Study
JGAS000086

解析手法

WES

材料と対象者

胃がん: 75症例(合計214検体) 非腫瘍組織(正常組織): 75検体 腫瘍組織(原発巣・転移巣): 139検体

実験方法

Exome

プラットフォーム

Illumina [HiSeq 2000]

試料説明

胃がん75症例の原発巣及び再発巣の腫瘍組織、非腫瘍組織より抽出したDNA

ライブラリ構築

SureSelect Human All Exon V4 + lincRNA、SureSelect Human All Exon V5 + lincRNA

断片化

超音波断片化(Covaris E220)

リードタイプ

Paired-end

リード長

100 bp

JGAデータセットAccession
総データ量

5 TB (fastq [428 files])

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