データセット ID
JGAD000086
- データの種類
- NGS（Exome）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 5.7 TB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0133
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-09-28
- DDBJ Search
- JGAD000086 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000086 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- 胃がん：75症例（合計214検体）
非腫瘍組織（正常組織）：75検体
腫瘍組織（原発巣・転移巣）：139検体 - 健康状態罹患
- 対象者数75 (人数)
- 試料説明
- 胃がん75症例の原発巣及び再発巣の腫瘍組織、非腫瘍組織より抽出したDNA
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- SureSelect Human All Exon V4
SureSelect Human All Exon V5 + lincRNA - 断片化
- 超音波断片化（Covaris E220）
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 100 bp