データセット ID
JGAD000077
- データの種類
- NGS（RNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 46.6 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0088
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-11-18
- DDBJ Search
- JGAD000077 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000077 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA-seq
- 材料と対象者
- 神経膠芽腫（ICD10：C71.9）：2症例（TGS-01、TGS-04）
- 健康状態罹患
- 対象者数2 (人数)
- 疾患
- 神経膠芽腫 (C719)
- 試料説明
- RNA抽出24時間前にBMP-4で刺激した神経膠芽腫から樹立したグリオーマ幹細胞株（TGS-01、TGS-04）より抽出したmRNA
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 細胞株
- Glioma stem cell line
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Ion Total RNA-Seq Kit v2
ScriptSeq v2 RNA-seq Library Preparation Kit - 断片化
- Genome Analyzer IIx：酵素反応
Ion Proton：酵素反応（RNase III） - プラットフォーム
- Illumina Genome Analyzer IIx
Thermo Fisher Scientific Ion Proton - リードタイプ
- 混在
- リード長
- Genome Analyzer IIx: 76 bp
Ion Proton: 200 bp