データセット ID
JGAD000065
- データの種類
- NGS（PCR amplicon Seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 933 MB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0068
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2024-10-17
- DDBJ Search
- JGAD000065 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000065 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA Amplicon-seq
- 材料と対象者
- 肺腺がん（ICD10：C349）：8症例（7検体）
- 健康状態罹患
- 対象者数8 (人数)
- 疾患
- 肺腺がん (C349)
- 試料説明
- 肺腺がん組織より抽出したRNAを逆転写したcDNA
- 組織肺
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Amplicon-seq
- 測定対象
- EGFR・KRAS領域、および、EML4-ALK・KIF5B-RET領域
検体1：EML4-ALK保有1症例（EML4-ALK領域）と KIF5B-RET保有1症例（KIF5B-RET領域）の増幅産物の混合検体（1検体）
検体2～7：EGFRとKRAS領域の増幅産物（6検体） - 試薬キット
- Nanopore Sequencing Kit
- 断片化
- PCR
- プラットフォーム
- Oxford Nanopore Technologies MinION
- リードタイプ
- シングルエンド
- リード長
- N/A