2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします
現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです
JGAD000052
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-09-28
- 研究
- hum0041
- データの種類
- NGS(Exome、Target Capture)
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- JGA Study
- JGAS000052
解析手法
WES + Targeted DNA sequencing
- 材料と対象者
難治性肝がん33症例の腫瘍組織および周囲の非腫瘍組織 ・ミラノ基準外再発例: 16症例 ・ミラノ基準内例: 17症例
- 実験方法
Exome、Target Capture
- ターゲット
SureSelect Human All Exon V4 + HBVゲノム + lincRNA
- プラットフォーム
Illumina [HiSeq 2000]
- 試料説明
主腫瘍組織および周囲の非腫瘍組織から抽出したgDNA (フェノール・クロロホルム法)
- ライブラリ構築
SureSelect Human All Exon V4
- 断片化
超音波断片化(Covaris S220)
- リードタイプ
Paired-end
- リード長
100 bp x 2
- JGAデータセットAccession
- 総データ量
1759 GB (fastq.gz)
- 利用ポリシー