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NBDC ヒトデータベース
JGAD000047
公開日
2020-09-28

更新日
2020-09-28

研究
hum0045

データの種類
NGS(RNA-seq)

アクセス制限
制限公開(Type I)

JGA Study
JGAS000047

解析手法

RNA-seq

材料と対象者

フィラデルフィア染色体陰性ALL: 99症例、フィラデルフィア染色体陽性ALL: 3症例、 セルライン: 5検体、正常血球細胞: 8検体

実験方法

RNA-seq

プラットフォーム

Illumina [HiSeq 2000/2500]

試料説明

【フィラデルフィア染色体陰性/陽性ALL検体】 末梢血もしくは骨髄液から抽出したmRNA 【セルライン、正常血球細胞】 培養された細胞から抽出したmRNA

細胞株

セルライン、正常血球細胞(Takara/Lonzaより購入)

ライブラリ構築

NEBNext Ultra Directional RNA Library Prep Kit for Illumina

断片化

熱処理

リードタイプ

Paired-end

リード長

104 bp

JGAデータセットAccession
総データ量

3.29 TB(fastq)

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