データセット ID
JGAD000047
- データの種類
- NGS（RNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 3.7 TB
- ファイル形式
- FASTQ
- TAR
- 研究
- hum0045
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-09-28
- DDBJ Search
- JGAD000047 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000047 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA-seq
- 材料と対象者
- フィラデルフィア染色体陰性ALL：99症例、フィラデルフィア染色体陽性ALL：3症例、
セルライン：5検体、正常血球細胞：8検体 - 健康状態混在
- 対象者数115 (混在)
- 試料説明
- 【フィラデルフィア染色体陰性/陽性ALL検体】
末梢血もしくは骨髄液から抽出したmRNA
【セルライン、正常血球細胞】
培養された細胞から抽出したmRNA - 組織骨髄、末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- NEBNext Ultra Directional RNA Library Prep Kit for Illumina
- 断片化
- 熱処理
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2000
Illumina HiSeq 2500 - リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 104 bp
- 表現型データの有無
- あり