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NBDC ヒトデータベース

カートに入れたデータセットはありません。

システムメンテナンスに伴い、以下の日程で、NBDCヒトデータベース申請システムならびにヒトデータ審査委員会による審査が停止いたします。
停止期間:2026年10月5日(月) 9:00 ~ 10月7日(水) 15:00
ご迷惑をおかけしますが、どうぞ宜しくお願いいたします。

現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所(NIG)バイオデータ研究拠点(BSI)ライフサイエンス統合データベース部門(DBCLS)」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

データセット ID

JGAD000015

データの種類
NGS(Target Capture)
アクセス制限
制限公開(Type I)
総データ量
3.1 GB
ファイル形式
  • FASTA
  • SFF
研究
hum0011
公開日
2020-09-28
更新日
2020-11-18

解析手法

Targeted DNA sequencing

材料と対象者
PLC/PRF/5細胞株 1サンプル、
HepG22215細胞株 1サンプル、
HBV感染ヒト肝がん 8症例
  • 健康状態
    罹患
  • 対象者数
    10 (混在)
試料説明
HBV感染ヒト肝がん臨床組織
  • 組織
    肝臓
  • 腫瘍 / 非腫瘍
    腫瘍
細胞株
HepG2
PLC/PRF/5
試料の入手元
PLC/PRF/5細胞株(肝がん細胞、HBs抗原陽性)
HepG22215細胞株(肝がん細胞、HBVが組込まれている)
実験方法
Targeted DNA sequencing
測定対象
HBVゲノム組み込み部位を含むヒトゲノム
断片化
超音波断片化(Covaris)
プラットフォーム
Roche GS FLX Titanium
リード長
321.1 bp
表現型データの有無
あり