データセット ID
JGAD000015
- データの種類
- NGS(Target Capture)
- アクセス制限
- 制限公開(Type I)
- 総データ量
- 3.1 GB
- ファイル形式
- FASTA
- SFF
- 研究
- hum0011
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-11-18
- DDBJ Search
- JGAD000015 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000015 (新しいタブで開きます)
解析手法
Targeted DNA sequencing
- 材料と対象者
- PLC/PRF/5細胞株 1サンプル、
HepG22215細胞株 1サンプル、
HBV感染ヒト肝がん 8症例 - 健康状態罹患
- 対象者数10 (混在)
- 試料説明
- HBV感染ヒト肝がん臨床組織
- 組織肝臓
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 細胞株
- HepG2
PLC/PRF/5 - 試料の入手元
- PLC/PRF/5細胞株(肝がん細胞、HBs抗原陽性)
HepG22215細胞株(肝がん細胞、HBVが組込まれている) - 実験方法
- Targeted DNA sequencing
- 測定対象
- HBVゲノム組み込み部位を含むヒトゲノム
- 断片化
- 超音波断片化(Covaris)
- プラットフォーム
- Roche GS FLX Titanium
- リード長
- 321.1 bp
- 表現型データの有無
- あり