2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします
現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです
JGAD000011
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-09-28
- 研究
- hum0019
- データの種類
- NGS(RNA-seq)
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- JGA Study
- JGAS000011
解析手法
RNA-seq
- 材料と対象者
消化器がん患者: 17症例
- 実験方法
RNA-seq
- プラットフォーム
Illumina [HiSeq 2500]
- 試料説明
消化器がん切片から腫瘍組織と非腫瘍組織を取り分け、polyA RNAを抽出
- ライブラリ構築
SureSelect XT RNA Target Enrichment for Illumina Multiplexed Sequencing
- 断片化
上記kit中のRNA Seq Fragmentation Mix
- リードタイプ
Paired-end
- リード長
100 bp x 2
- JGAデータセットAccession
- 総データ量
104 GB(fastq [1,193,969.914 reads / 338 files])
- 利用ポリシー