データセット ID
JGAD000011
- データの種類
- NGS（RNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 112 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0019
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-09-28
- DDBJ Search
- JGAD000011 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000011 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA-seq
- 材料と対象者
- 消化器がん患者：17症例
- 健康状態罹患
- 対象者数17 (人数)
- 試料説明
- 消化器がん切片から腫瘍組織と非腫瘍組織を取り分け、polyA RNAを抽出
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- SureSelect XT RNA Target Enrichment
- 断片化
- 上記kit中のRNA Seq Fragmentation Mix
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 100 bp