データセット ID
E-GEAD-746
- データの種類
- NGS（Micro-C and Region Capture Micro-C）
NGS（CITE-seq and 5' single-cell RNA-seq）
NGS（5' and 3' single-cell RNA-seq）
NGS（Multimodal assay including single-nucleus ATAC-seq, 3' and 5' single-nucleus RNA-seq, and 5' single-cell RNA-seq）
NGS（MAS-seq）
NGS（CAGE-seq and NET-CAGE-seq） - アクセス制限
- 非制限公開
- 総データ量
- 54.1 MB
- ファイル形式
- BED
- TXT
- 研究
- hum0350
- 公開日
- 2024-05-14
- 更新日
- 2024-06-29
- DDBJ Search
- E-GEAD-746 (新しいタブで開きます)
解析手法
CAGE-seq + NET-CAGE-seq
- 材料と対象者
- 日本人健常者：2名
CD4陽性T細胞：6検体 - 健康状態健常
- 対象者数2 (人数)
- 対象集団日本人
- 試料説明
- 全血から分離したCD4陽性T細胞から抽出したtotal RNAと核RNA
- 組織CD4 陽性 T 細胞、末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- CAGE-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- CAGE Preparation Kit
- 断片化
- N/A
- プラットフォーム
- Illumina NextSeq 500
- リードタイプ
- シングルエンド
- リード長
- N/A
- 参照ゲノム
- GRCh38
- マッピング
- STAR version 2.7.10b