データセット ID
E-GEAD-739
- データの種類
- NGS（CAGE-seq [CRISPR-activated Jurkat cells]）
- アクセス制限
- 非制限公開
- 総データ量
- 444 MB
- ファイル形式
- BED
- 研究
- hum0350
- 公開日
- 2024-05-14
- 更新日
- 2024-06-28
- DDBJ Search
- E-GEAD-739 (新しいタブで開きます)
解析手法
CAGE-seq
- 材料と対象者
- CRISPR-activated Jurkat cells：15検体
- 対象者数15 (検体数)
- 試料説明
- CRISPR-activated Jurkat cellsから抽出したtotal RNA
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 細胞株
- Jurkat
- 試料の入手元
- RIKEN BRC RCB0806
- 実験方法
- CAGE-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- CAGE Preparation Kit
- 断片化
- N/A
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- N/A
- 参照ゲノム
- GRCh38
- マッピング
- STAR version 2.7.10b