データセット ID
E-GEAD-635
- データの種類
- NGS（CITE-seq）
- アクセス制限
- 非制限公開
- 総データ量
- 323 MB
- ファイル形式
- TXT
- HDF5
- 研究
- hum0416
- 公開日
- 2023-08-10
- 更新日
- 2023-08-10
- DDBJ Search
- E-GEAD-635 (新しいタブで開きます)
解析手法
CITE-seq
- 材料と対象者
- 顕微鏡的多発血管炎（ICD10：M31.7）：8症例
内、3症例は2時点採取、5症例は1時点採取
健常者：7名 - 健康状態混在
- 対象者数15 (人数)
- 疾患
- 顕微鏡的多発血管炎
- 試料説明
- 末梢血よりPBMCを取得し、単細胞へ分離した上で抽出したmRNA
- 組織末梢血単核球 (PBMC)、末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- CITE-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Chromium Next GEM Single Cell 5' v2
- 断片化
- 酵素反応
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
Illumina NovaSeq 6000 - リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 91 bp
- 参照ゲノム
- GRCh38
- QC・フィルタリング
- Cell Ranger Metrics
- 解析方法
- CellRanger（version 6.0.6）
- 加工データの種類
- 遺伝子発現行列