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NBDC ヒトデータベース

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現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所(NIG)バイオデータ研究拠点(BSI)ライフサイエンス統合データベース部門(DBCLS)」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

データセット ID

DRA016394

データの種類
NGS(Iso-seq)
アクセス制限
非制限公開
総データ量
4.0 GB
ファイル形式
  • FASTQ
研究
hum0312
公開日
2024-06-03
更新日
2024-06-25

解析手法

Iso-seq

材料と対象者
健常人: 2名
IFNa2刺激有条件下で培養したLCL: 1検体
  • 健康状態
    健常
  • 対象者数
    2 (人数)
試料説明
LCLから抽出したtotal RNA
  • 組織
    リンパ芽球様細胞株
細胞株
Coriell cell line
GM12878
試料の入手元
GM19078、GM12878(Coriell Institute)
実験方法
Iso-seq
測定対象
N/A
試薬キット
SMRTbell Express Template Prep Kit 3.0
断片化
N/A
プラットフォーム
PacBio Sequel II
PacBio Sequel IIe
リードタイプ
シングルエンド
リード長
N/A