データセット ID
DRA014819
- データの種類
- NGS（Target Capture）
- アクセス制限
- 非制限公開
- 総データ量
- 9.9 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0335
- 公開日
- 2022-09-13
- 更新日
- 2022-09-13
- DDBJ Search
- DRA014819 (新しいタブで開きます)
解析手法
Targeted DNA sequencing
- 材料と対象者
- WM （ICD10: C880）：10症例
骨髄単核球：5検体、末梢血単核球：1検体、骨髄ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）検体：2検体、リンパ節FFPE検体：2検体
non IgM-type LPL （ICD10: C830）：10症例
骨髄単核球：3検体、末梢血単核球：3検体、骨髄FFPE検体：4検体 - 健康状態罹患
- 対象者数20 (人数)
- 疾患
- WM (C880)
non IgM-type LPL (C830) - 試料説明
- 骨髄単核球、末梢血単核球、骨髄FFPE検体およびリンパ節FFPE検体から抽出したDNA
- 組織骨髄、Bone marrow mononuclear cell、リンパ節、末梢血単核球 (PBMC)、末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Targeted DNA sequencing
- 測定対象
- ARID1A、NOTCH2、CXCR4、MYD88、PRDM1、CD274、PDCD1LG2、RAG2、KMT2D、MYBBP1A、TP53、CD79B
- 試薬キット
- AmpliSeq Custom Panel
- 断片化
- N/A
- プラットフォーム
- Illumina NextSeq 500
- リードタイプ
- シングルエンド
- リード長
- 151 bp
- 参照ゲノム
- GRCh37