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NBDC ヒトデータベース

研究題目

沖縄県におけるゲノム解析研究拠点形成のための沖縄バイオインフォメーションバンクの構築

研究概要

目的: 沖縄バイオインフォメーションバンク (OBi) は、沖縄県民の特徴的な遺伝的背景ならびに疾患感受性機構解明のためのヒトゲノムDNA、血漿 (あるいは血清) および臨床情報を統合した資源バンクであり、様々な疾患の病態解明や治療法・予防法の開発のための基盤として構築している。

研究方法: SNPアレイにより遺伝型を取得し、Impuationにより最大9,235,975 SNPsの推定遺伝型を得た。研究グループごとに血清ALT値、AST値、GGT値に対して関連解析を行い、その結果をメタ解析で統合した。

対象: OBiおよびバイオバンク・ジャパン (BBJ) に登録された一般集団のうち、PCAまたはPCA-UMAPに基づき分類されたRyukyuクラスターに属し、血清ALT/AST/GGT値のデータが利用可能な研究対象者 (OBi: 8,715名、BBJ: 7,004名) 、OBiに登録されPCA-UMAPに基づき分類されたHondoクラスター 1,420名

データセット一覧

データセット ID
アクセス制限
データの種類
公開日
hum0496.v1.gwas.v1非制限公開血清ALT値、AST値、GGT値のGWAS2025-02-27

提供者情報

    代表者
    前田 士郎/今村 美菜子
    所属機関
    琉球大学大学院医学研究科 先進ゲノム検査医学講座

研究プロジェクト情報

研究プロジェクト名
URL
データなし

助成金情報

科研費・助成金名
タイトル
研究課題番号
沖縄イノベーション・エコシステム共同研究推進事業沖縄県の健康長寿復興を目指した疾患ゲノム研究とゲノム情報の実装事業
    琉球大学医学部 先端医学研究支援事業琉球集団を対象とした疾患ゲノム解析とその臨床応用

      関連論文

      タイトル
      DOI
      データセット
      A variant in HMMR/HMMR-AS1 is associated with serum alanine aminotransferase levels in the Ryukyu populationhttps://doi.org/10.1038/s41598-025-90195-w

      制限公開データの利用者一覧

      名前
      所属機関
      研究題目
      データ利用期間
      データセット一覧
      データなし