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NBDC ヒトデータベース

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2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所(NIG)バイオデータ研究拠点(BSI)ライフサイエンス統合データベース部門(DBCLS)」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

研究 ID

hum0496-v1リリース情報

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最新バージョン (v2)

研究題目

沖縄県におけるゲノム解析研究拠点形成のための沖縄バイオインフォメーションバンクの構築

研究概要

目的
沖縄バイオインフォメーションバンク(OBi)は、沖縄県民の特徴的な遺伝的背景ならびに疾患感受性機構解明のためのヒトゲノムDNA、血漿(あるいは血清)および臨床情報を統合した資源バンクであり、様々な疾患の病態解明や治療法・予防法の開発のための基盤として構築している。
研究方法
SNPアレイにより遺伝型を取得し、Impuationにより最大9,235,975 SNPsの推定遺伝型を得た。研究グループごとに血清ALT値、AST値、GGT値に対して関連解析を行い、その結果をメタ解析で統合した。
対象
OBiおよびバイオバンク・ジャパン(BBJ)に登録された一般集団のうち、PCAまたはPCA-UMAPに基づき分類されたRyukyuクラスターに属し、血清ALT/AST/GGT値のデータが利用可能な研究対象者(OBi:8,715名、BBJ:7,004名)、OBiに登録されPCA-UMAPに基づき分類されたHondoクラスター 1,420名

データセット

データセットの一覧はこのバージョンのものですが、各データセットの内容は現在のものを表示しています。

カートデータセット IDデータの種類解析手法アクセス制限公開日
NHA000200血清ALT値、AST値、GGT値のGWAS
  • Genotyping by array (GWAS)
非制限公開2025-02-27

提供者

研究代表者
前田 士郎
所属機関
琉球大学大学院医学研究科 先進ゲノム検査医学講座
研究代表者
今村 美菜子
所属機関
琉球大学大学院医学研究科 先進ゲノム検査医学講座

研究プロジェクト情報

研究プロジェクト情報はありません。

助成金情報

科研費・助成金名研究課題名研究課題番号
沖縄イノベーション・エコシステム共同研究推進事業
沖縄県の健康長寿復興を目指した疾患ゲノム研究とゲノム情報の実装事業
N/A
琉球大学医学部 先端医学研究支援事業
琉球集団を対象とした疾患ゲノム解析とその臨床応用
N/A

関連論文

タイトルDOIデータセット ID
A variant in HMMR/HMMR-AS1 is associated with serum alanine aminotransferase levels in the Ryukyu population