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NBDC ヒトデータベース

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2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所(NIG)バイオデータ研究拠点(BSI)ライフサイエンス統合データベース部門(DBCLS)」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

研究 ID

hum0479-v1リリース情報

最新

研究題目

網羅的遺伝子解析技術を用いた抗EGFR抗体薬治療効果予測バイオマーカーの探索研究に関する多施設共同研究

研究概要

目的
切除不能・進行再発大腸がん症例を対象に、網羅的遺伝子解析技術を用いて抗EGFR(Epidermal Growth Factor Receptor)抗体薬の臨床効果を予測する新しいバイオマーカーを探索する。探索は、抗EGFR抗体薬の投与を受けた登録症例の腫瘍組織および非腫瘍組織のホルマリン固定パラフィン包埋標本および血液検体から抽出したDNAを用いて、全エクソンシークエンス解析及び SNP(Single Nucleotide Polymorphism)アレイを用いたGWAS(Genome Wide Association Study)および CNV(Copy Number Variation)解析を行い、統計学的手法を用いて、治療効果や重篤な有害事象に関連した体細胞変異およびSNPを同定し、登録症例の治療効果との相関を検討する。
研究方法
①を対象とした全エクソン解析、ならびに、➁を対象とした①の解析で見いだされたSNP/CNV領域のターゲットシーケンス解析
対象
切除不能・進行再発大腸がん
①探索用コホート:92症例(2008年9月から2010年5月までにセツキシマブを含む治療を受けた症例)
②統計的推測用コホート:150症例(2010 年6月から各施設倫理審査委員会承認日までにセツキシマブまたはパニツムマブを含む治療を受けた症例)

データセット

カートデータセット IDデータの種類解析手法アクセス制限公開日
JGAD000921NGS(Exome)
NGS(Target Capture)
  • WES
  • Targeted DNA sequencing
制限公開(Type I)2025-04-15

提供者

研究代表者
土原 一哉
所属機関
国立がん研究センター 先端医療開発センター

研究プロジェクト情報

助成金情報

科研費・助成金名研究課題名研究課題番号
国立研究開発法人科学技術振興機構(JST)研究成果最適展開支援プログラム A-STEP 本格研究開発ステージ 実用化挑戦タイプ
網羅的ゲノム解析に基づく抗EGFR抗体薬治療効果予測診断キット
  • JPMJTT11S8

関連論文

タイトルDOIデータセット ID
Clinical significance of BRAF non-V600E mutations on the therapeutic effects of anti-EGFR monoclonal antibody treatment in patients with pretreated metastatic colorectal cancer: the Biomarker Research for anti-EGFR monoclonal Antibodies by Comprehensive Cancer genomics (BREAC) study

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