研究 ID
hum0470-v1リリース情報
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研究題目
免疫治療が施行された尿路上皮癌における予後調査とゲノムプロファイルの解明
研究概要
- 目的
- 尿路上皮がん症例の免疫治療後の予後を調査するとともに、病理診断後の組織検体を用いたゲノム不安定性の有無を明らかにすることで、ゲノム不安定性の有無が尿路上皮がんへの免疫治療の効果を正確に反映し、治療の継続・変更を判断するための有用なバイオマーカー（病気の有無や進行度、治療効果の指標）となりうるか、また、新規薬剤の開発に繋がる医療情報となりうるかについて検討する。
- 研究方法
- Whole exome sequencing、RNA sequencing、Whole genome sequencing、single cell RNA sequencing、空間的トランスクリプトーム解析（Visium）
- 対象
- 尿路上皮がん（右腎臓の多発性遠隔転移を伴う局所進行腎盂がん）と診断され、免疫療法が施行された1症例。腫瘍組織検体は8臓器（原発巣、腫瘍周辺、後腹膜リンパ節、2つの異なる傍大動脈リンパ節、頸部リンパ節、右肺転移、左肺転移）、もしくは5臓器（原発巣腫瘍中心、後腹膜リンパ節、傍大動脈リンパ節、頸部リンパ節、左肺転移）より取得。
- URL
- N/A
データセット
| カート | データセット ID | データの種類 | 解析手法 | アクセス制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|---|---|
| JGAD000858 | NGS（Exome） NGS（RNA-seq） NGS（WGS） NGS（scRNA-seq） NGS（Visium Spatial Gene Expression）、病理画像 |
| 制限公開（Type I） | 2025-07-09 |
提供者
- 研究代表者
- 田中 伸之
- 所属機関
- 慶應義塾大学医学部 泌尿器科学教室
研究プロジェクト情報
| 研究プロジェクト名 | URL |
|---|---|
慶應義塾大学医学部泌尿器科学教室/東京大学大学院理学系研究科生物科学専攻角田研究室/東京科学大学総合研究院M&Dデータ科学センター | N/A |
助成金情報
| 科研費・助成金名 | 研究課題名 | 研究課題番号 |
|---|---|---|
科学研究費助成事業 若手研究 | 腫瘍免疫に注目した遺伝子発現と病理組織による粘液型脂肪肉腫の予後予測モデルの構築 |
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科学研究費助成事業 若手研究 | がん免疫療法治療前後の多領域シーケンス解析による治療効果関連因子の特定 |
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科学研究費助成事業 基盤研究（C） | 膀胱がんにおけるlong non-coding RNAが担う役割の解明 |
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科学研究費助成事業 挑戦的研究（萌芽） | がん多様性をin situで見える化する解析プラットフォーム構築と臨床応用 |
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科学研究費助成事業 基盤研究（B） | In situな尿路上皮がん免疫ゲノミクス多様性解析とリキッドバイオプシーの確立 |
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科学研究費助成事業 挑戦的研究（開拓） | がん免疫治療下における間質軌跡地図の空間解析と新しい間質リプログラミング法の確立 |
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科学研究費助成事業 基盤研究（A） | 泌尿器がんのクローン進化と腫瘍間質の空間解析による免疫治療耐性メカニズムの解明 |
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科学研究費助成事業 基盤研究（B） | 画像変換と深層学習によるマルチオミクス統合解析と病態や薬剤応答機序の解明の方法論 |
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科学研究費助成事業 基盤研究（B） | オミクスデータを量子計算に導き量子古典ハイブリッド機械学習で予測モデルを作る方法 |
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JST ムーンショット型研究開発事業 | 細胞内サイバネティック・アバターの遠隔制御によって見守られる社会の実現 |
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JST 戦略的創造研究推進事業 CREST | 生体環境からのAI駆動型1分子ナノポア計測法の開発 |
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関連論文
関連論文はありません。
制限公開データの利用者一覧
| 研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | データ利用期間 | データセット ID |
|---|---|---|---|---|---|
| 浜田 道昭 | 浜田研究室, 理工学術院, 早稲田大学 | 日本 | RNA標的創薬データベースの構築 | 2023-01-05 – 2027-10-31 |