HumanDBs

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

NBDC ヒトデータベース申請業務ならびにJGA関係の業務につきまして、以下の期間休業いたします：2026年8月12日(水) 〜 2026年8月17日(月) 休業期間中にいただいた申請やお問い合わせ等は、休業明けの 8月18日(火) より順次対応させていただきます。上記休業期間の前後は通常より対応が遅れることがあります。予めご了承ください。ご迷惑をおかけいたしますが、ご理解とご協力をお願いいたします。

NBDC Research ID:hum0414-v1

リリース情報

研究題目

ゲノム解析に基づく肺がんの発生･進展の分子機構の解明

研究概要

目的: ヒト肺がん細胞における変異・欠失・増幅・過メチル化等、体細胞レベルで生じたゲノム異常と遺伝子発現変動を解析し、それらを臨床病理学的情報と対比検討することで肺がんの発生・進展の分子機構及び特性を遺伝子レベルで明らかにすること。

研究方法: ヒト小気道上皮細胞 (SAEC) は、hTERT・CDK4変異体・サイクリンD1の発現により不死化されている。KRAS G12Vを発現するSAEC (Control-ER-KRAS-G12V) を最大35日間2次元培養すると、限定的ではあるが有意な足場非依存性増殖を示す。これらのクローンをピックアップし、複製ストレス耐性細胞と名付けた (RSTC-2、RSTC-5、RSTC-7) 。これらの細胞株に対して、全ゲノムシークエンスを実施した。

対象: SAEC、Control-ER-KRAS-G12V、RSTC-2、RSTC-5、RSTC-7 (計5株)

データセット一覧

	データセット ID	アクセス制限	データの種類	公開日
	DRA016800	非制限公開	NGS(WGS)	2023-07-28

提供者情報

研究代表者: 塩谷文章
所属機関: 国立がん研究センター研究所

研究プロジェクト情報

研究プロジェクト名	URL
ゲノムストレス応答学ユニット	https://www.ncc.go.jp/jp/ri/division/genome_stress_signaling/index.html

助成金情報

科研費・助成金名	タイトル	研究課題番号
科学研究費助成事業国際共同研究加速基金 (国際共同研究強化 (B))	ゲノム不安定性を制御するDNA複製ストレス応答機構の解明	18KK0235
科学研究費助成事業基盤研究 (B)	ATRによるDNA複製ストレス抵抗性を介した発がん制御機構の解明	18H03378
国立研究開発法人科学技術振興機構 (JST) 戦略的創造研究推進事業 (CREST)	イノベーション創発に資する人工知能基盤技術の創出と統合化	JPMJCR1689
国立研究開発法人科学技術振興機構 (JST) AIPチャレンジPRISM加速支援 (AIP-PRISM)	人工知能技術を活用した革新的ながん創薬システムの開発	JPMJCR18Y4

タイトル	DOI	データセット
An ATR-PrimPol pathway confers tolerance to oncogenic KRAS-induced and heterochromatin-associated replication stress. Nature Communications.	https://doi.org/10.1038/s41467-023-40578-2	DRA016800

制限公開データの利用者一覧

研究代表者	所属機関	国・州名	研究題目	データ利用期間	利用データID
データなし