研究 ID
hum0414-v1リリース情報
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研究題目
ゲノム解析に基づく肺がんの発生･進展の分子機構の解明
研究概要
- 目的
- ヒト肺がん細胞における変異・欠失・増幅・過メチル化等、体細胞レベルで生じたゲノム異常と遺伝子発現変動を解析し、それらを臨床病理学的情報と対比検討することで肺がんの発生・進展の分子機構及び特性を遺伝子レベルで明らかにすること。
- 研究方法
- ヒト小気道上皮細胞（SAEC）は、hTERT・CDK4変異体・サイクリンD1の発現により不死化されている。KRAS G12Vを発現するSAEC（Control-ER-KRAS-G12V）を最大35日間2次元培養すると、限定的ではあるが有意な足場非依存性増殖を示す。これらのクローンをピックアップし、複製ストレス耐性細胞と名付けた（RSTC-2、RSTC-5、RSTC-7）。これらの細胞株に対して、全ゲノムシークエンスを実施した。
- 対象
- SAEC、Control-ER-KRAS-G12V、RSTC-2、RSTC-5、RSTC-7（計5株）
- URL
- N/A
データセット
| カート | データセット ID | データの種類 | 解析手法 | アクセス制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|---|---|
| DRA016800 | NGS（WGS） |
| 非制限公開 | 2023-07-28 |
提供者
- 研究代表者
- 塩谷 文章
- 所属機関
- 国立がん研究センター研究所
研究プロジェクト情報
| 研究プロジェクト名 | URL |
|---|---|
ゲノムストレス応答学ユニット | N/A |
助成金情報
| 科研費・助成金名 | 研究課題名 | 研究課題番号 |
|---|---|---|
科学研究費助成事業 国際共同研究加速基金（国際共同研究強化（B）） | ゲノム不安定性を制御するDNA複製ストレス応答機構の解明 |
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科学研究費助成事業 基盤研究（B） | ATRによるDNA複製ストレス抵抗性を介した発がん制御機構の解明 |
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国立研究開発法人科学技術振興機構（JST） 戦略的創造研究推進事業（CREST） | イノベーション創発に資する人工知能基盤技術の創出と統合化 |
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国立研究開発法人科学技術振興機構（JST） AIPチャレンジPRISM加速支援（AIP-PRISM） | 人工知能技術を活用した革新的ながん創薬システムの開発 |
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関連論文
| タイトル | DOI | データセット ID |
|---|---|---|
An ATR-PrimPol pathway confers tolerance to oncogenic KRAS-induced and heterochromatin-associated replication stress. |