hum0356-v1リリース情報

大腸発がんにおける遺伝子変化の解明と間質の臨床的意義の確立

目的

近年、single cell RNA sequence解析により、adenocarcinoma sequenceを背景とする大腸がんの腫瘍細胞と間質細胞における細胞間相互作用が解析されてきたが、空間的な視点が欠落していた。そのため、がん早期において重要ながん微小環境、特に免疫寛容の獲得機構に関しては明らかではない。今回は、公共データベースより得られたシングルセル解析データと空間的トランスクリプトーム解析データの統合解析により、腺腫がん境界部における免疫寛容および腫瘍微小環境の形成について調べた。この解析により、早期におけるがん細胞と免疫細胞との共局在状況や、浸潤先進部における細胞間相互作用について解析することで、免疫から逃避するメカニズムを明らかにし、新たな治療標的分子を探索する。

研究方法

手術による摘出検体を液体窒素にて凍結させた。その後、キャプチャ領域に合わせて切断し、クライオスタットを用いて10μmの切片に切り出した。この標本をVisium Spatialスライドに載せ、使用するまで-80 ℃で保存した。組織を透過酵素（10x Genomics: 2000214）で50分間透過処理し、0.1×SSCバッファー（Sigma-Aldrich）で洗浄し、画像化した。全ての工程は、製造元のプロトコール（CG000240 Rev D、CG000160 Rev A）に従って行った。

対象

adenocarcinoma sequenceを背景とした大腸がん症例

URL

N/A

研究代表者

三森 功士

所属機関

九州大学病院別府病院 外科