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NBDC ヒトデータベース
NBDC Research ID:hum0331-v1
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研究題目

がんや難病に関するゲノム医療の推進に必要な健常群 ・疾患コントロール群データの構築

研究概要

目的: 難病やがんを対象としたゲノム医療の推進のため、全ゲノムシークエンス解析が進められている。疾患ゲノム解析の遂行には、疾患群の対照となる健常人コントロール群の全ゲノム解析データも必要である。国内の6つの国立高度専門医療研究センター (ナショナルセンター[National Centers: NC]) のバイオバンクにおいて収集し、地域性を考慮した検体から難病やがんに対するコントロール群を選定の上、全ゲノム解析を実施することで、コントロール群のゲノムデータベースを構築する。

研究方法: 本研究の目的に適したDNAサンプルを各バイオバンクから選定し、受託解析機関で全ゲノムシークエンス (Whole genome sequencing: WGS) 解析を実施する。WGS解析はPCRフリープロトコルによりライブラリを調整し、NovaSeq 6000シークエンサーにてリードを取得することで、最低90Gbの出力を得る。解析で得られたfastq形式のリードデータは研究代表機関 (国立国際医療研究センター) において情報解析 (マッピング・バリアントコール) を行い、バリアント情報を含むデータをデータベース化する。

対象: 難病やがん研究のコントロール群として利用可能な健常者 (難病やがんを罹患していない生活習慣病を持つ人を含む) 9850名の内、QCにより除外された560名を除く9290名

データセット一覧

データセット ID
アクセス制限
データの種類
公開日
hum0331.v1.freq.v1非制限公開NGS(WGS)2023-02-01
hum0331.v1.freq-index.v1非制限公開NGS(WGS)2023-02-01

提供者情報

    代表者
    徳永 勝士
    所属機関
    国立国際医療研究センター ゲノム医科学プロジェクト

研究プロジェクト情報

研究プロジェクト名
URL
ナショナルセンターバイオバンクネットワーク

助成金情報

科研費・助成金名
タイトル
研究課題番号
日本医療研究開発機構 (AMED) 臨床ゲノム情報統合データベース整備事業ゲノム医療の実装に資する臨床ゲノム情報統合データベースの整備と我が国の継続的なゲノム医療実施体制の構築
  • JP19kk0205012

関連論文

タイトル
DOI
データセット
Exploring the genetic diversity of the Japanese population: Insights from a large-scale whole genome sequencing analysishttps://doi.org/10.1371/journal.pgen.1010625

制限公開データの利用者一覧

名前
所属機関
研究題目
データ利用期間
データセット一覧
データなし