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NBDC ヒトデータベース

カートに入れたデータセットはありません。

システムメンテナンスに伴い、以下の日程で、NBDCヒトデータベース申請システムならびにヒトデータ審査委員会による審査が停止いたします。
停止期間:2026年10月5日(月) 9:00 ~ 10月7日(水) 15:00
ご迷惑をおかけしますが、どうぞ宜しくお願いいたします。

現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所(NIG)バイオデータ研究拠点(BSI)ライフサイエンス統合データベース部門(DBCLS)」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

研究 ID

hum0320-v1リリース情報

最新

研究題目

悪性腫瘍を有する患者を対象とした免疫モニタリング研究

研究概要

目的
悪性腫瘍を有する患者における末梢血や腫瘍組織等での種々の免疫担当細胞や免疫担当因子などを解析し、その免疫学的状態を明らかにする。副次的に免疫状態と臨床病理学的特徴、分子生物学的特徴、治療効果や予後との関連について検討する。
研究方法
免疫担当細胞(CD4/CD8T細胞、抗原提示細胞、制御性T細胞、 MDSC、自然リンパ球など)におけるCD4, CD8, FoxP3, CD25, CD45RA, CTLA-4, PD-1, ICOS, BTLA, Tim-3, LAG3, CCR7などの分子発現について、シングルセルシークエンスを用いた免疫フェノタイプ解析を実施した。併せて、免疫細胞のT-cell receptor(TCR)の解析を実施した。
対象
肺腺がん2症例および頭頸部がん3症例(腫瘍組織1検体、リンパ節1検体、末梢血1検体、計15検体)
URL
N/A

データセット

カートデータセット IDデータの種類解析手法アクセス制限公開日
JGAD000597NGS(scRNA-seq、TCR-seq)
  • scRNA-seq
  • TCR-seq
制限公開(Type I)2022-01-24

提供者

研究代表者
冨樫 庸介
所属機関
千葉県がんセンター研究所

研究プロジェクト情報

研究プロジェクト情報はありません。

助成金情報

科研費・助成金名研究課題名研究課題番号
科学研究費助成事業 基盤研究(B)
がん抗原階層性からの腫瘍浸潤PD-1陽性T細胞の抗腫瘍免疫応答及び抑制能の解明
  • 20H03694
日本医療研究開発機構(AMED) 革新的がん医療実用化研究事業
シングルセルシークエンスによるネオ抗原特異的T細胞の時空間的解析から治療標的・バイオマーカーへの応用
  • JP19ck0106521
日本医療研究開発機構(AMED) 次世代がん医療創生研究事業(P-CREATE)
T細胞受容体認識エピトープによる腫瘍浸潤Tリンパ球の次世代解析方法の開発
  • JP18cm0106340
日本医療研究開発機構(AMED) 次世代がん医療創生研究事業(P-CREATE)
ゲノム異常を有する腫瘍浸潤リンパ球の1細胞解析方法の開発とその臨床的意義の解明
  • JP21cm0106383

関連論文

タイトルDOIデータセット ID
PD-1 blockade therapy promotes infiltration of tumor-attacking exhausted T cell clonotypes

制限公開データの利用者一覧

研究代表者所属機関国・州名研究題目データ利用期間データセット ID
Ansuman SatpathyDepartment of Pathology, Stanford Universityアメリカ合衆国Epigenetics of Inflammatory Skin Disorders2022-07-13 – 2023-11-06
浜田 道昭浜田研究室, 理工学術院, 早稲田大学日本RNA標的創薬データベースの構築2023-01-05 – 2027-10-31