研究題目
食道がんの全ゲノムシークエンス解析による病態解明と治療感受性マーカーの探索に関する研究
研究概要
目的: 日本人の食道扁平上皮がんにおけるゲノム変異を探索する
研究方法: 食道扁平上皮がん切除切片における非腫瘍組織 (正常組織) および腫瘍組織より抽出したDNAを用いたWhole Genome Sequencing解析、ならびに、腫瘍組織より抽出したRNAを用いたRNA-seq解析。
対象: 食道扁平上皮がん症例の腫瘍組織および非腫瘍組織
2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします
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NBDC Research ID:hum0316-v1
リリース情報 データセット一覧
データセット ID | アクセス制限 | データの種類 | 公開日 | |
|---|---|---|---|---|
| JGAD000654 | 制限公開（Type I） | NGS(WGS) NGS(RNA-seq) | 2022-05-25 | |
提供者情報
- 研究代表者
- 中川 英刀
- 所属機関
- 理化学研究所 生命医科学研究センター がんゲノム研究チーム
研究プロジェクト情報
研究プロジェクト名 | URL |
|---|---|
| データなし | |
助成金情報
科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
|---|---|---|
| 日本医療研究開発機構 (AMED) 次世代がん医療創生研究事業 (P-CREATE) | がんゲノム解析による新規免疫療法および複合免疫療法開発のためのシーズ探索 |
|
関連論文
タイトル | DOI | データセット |
|---|---|---|
| Immuno-genomic Profiling of Biopsy Specimens Predicts Neoadjuvant Chemotherapy Response in Esophageal Squamous Cell Carcinoma | https://doi.org/10.1016/j.xcrm.2022.100705 | |
制限公開データの利用者一覧
研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | データ利用期間 | 利用データID |
|---|---|---|---|---|---|
| 浜田道昭 | Waseda University | Japan | RNA標的創薬データベースの構築 | 2023-01-05—2027-10-31 | |
| 杉田静紀 | Nagoya University Graduate School of Medicine | Japan | 全ゲノム解析による食道癌の周術期補助療法と早期再発に関する研究 | 2023-04-07—2023-12-07 | |