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NBDC ヒトデータベース

カートに入れたデータセットはありません。

システムメンテナンスに伴い、以下の日程で、NBDCヒトデータベース申請システムならびにヒトデータ審査委員会による審査が停止いたします。
停止期間:2026年10月5日(月) 9:00 ~ 10月7日(水) 15:00
ご迷惑をおかけしますが、どうぞ宜しくお願いいたします。

現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所(NIG)バイオデータ研究拠点(BSI)ライフサイエンス統合データベース部門(DBCLS)」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

研究 ID

hum0305-v1リリース情報

最新

研究題目

造血細胞移植後二次がんの細胞遺伝学的特徴に関する多施設後方視的研究

研究概要

目的
造血細胞移植後2次固形がんは、通常のがんと比較して、固有のゲノム異常プロファイルを有した腫瘍である可能性がある。2次固形がんと通常のがんの検体を対象とした全エクソン配列決定解析を行うことにより、我々の仮説を検証する。
研究方法
ゲノムDNAは、凍結新鮮検体はQIAamp Fast DNA Tissue kit、FFPE検体はGeneRead DNA FFPE kitを用いて調整した。全エクソームシークエンス(Whole Exome Sequence:WES)解析用のライブラリはTwist社のTwist library preparation kitを用いて作製した。作製したライブラリはIllumina社 Novaseq 6000またはMGI社DNBSEQ-G400でシークエンス解析を行った。
対象
固形がん14症例の腫瘍組織凍結検体14検体、および、ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)14検体
URL
N/A

データセット

カートデータセット IDデータの種類解析手法アクセス制限公開日
JGAD000491NGS(Exome)
  • WES
制限公開(Type I)2021-11-04

提供者

研究代表者
稲本 賢弘
所属機関
国立がん研究センター中央病院 造血幹細胞移植科

研究プロジェクト情報

研究プロジェクト名URL
造血細胞移植後2次固形がんのゲノム解析
N/A

助成金情報

科研費・助成金名研究課題名研究課題番号
日本医療研究開発機構(AMED) 革新的がん医療実用化研究事業
ゲノム解析に基づいた造血細胞移植後2次固形がん最適個別化医療の実現
  • JP20ck0106539

関連論文

タイトルDOIデータセット ID
MicroSEC filters sequence errors for formalin-fixed and paraffin-embedded samples

制限公開データの利用者一覧

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