研究 ID
hum0305-v1リリース情報
最新
研究題目
造血細胞移植後二次がんの細胞遺伝学的特徴に関する多施設後方視的研究
研究概要
- 目的
- 造血細胞移植後2次固形がんは、通常のがんと比較して、固有のゲノム異常プロファイルを有した腫瘍である可能性がある。2次固形がんと通常のがんの検体を対象とした全エクソン配列決定解析を行うことにより、我々の仮説を検証する。
- 研究方法
- ゲノムDNAは、凍結新鮮検体はQIAamp Fast DNA Tissue kit、FFPE検体はGeneRead DNA FFPE kitを用いて調整した。全エクソームシークエンス（Whole Exome Sequence：WES）解析用のライブラリはTwist社のTwist library preparation kitを用いて作製した。作製したライブラリはIllumina社 Novaseq 6000またはMGI社DNBSEQ-G400でシークエンス解析を行った。
- 対象
- 固形がん14症例の腫瘍組織凍結検体14検体、および、ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）14検体
- URL
- N/A
データセット
| カート | データセット ID | データの種類 | 解析手法 | アクセス制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|---|---|
| JGAD000491 | NGS（Exome） |
| 制限公開（Type I） | 2021-11-04 |
提供者
- 研究代表者
- 稲本 賢弘
- 所属機関
- 国立がん研究センター中央病院 造血幹細胞移植科
研究プロジェクト情報
| 研究プロジェクト名 | URL |
|---|---|
造血細胞移植後2次固形がんのゲノム解析 | N/A |
助成金情報
| 科研費・助成金名 | 研究課題名 | 研究課題番号 |
|---|---|---|
日本医療研究開発機構（AMED） 革新的がん医療実用化研究事業 | ゲノム解析に基づいた造血細胞移植後2次固形がん最適個別化医療の実現 |
|
関連論文
| タイトル | DOI | データセット ID |
|---|---|---|
MicroSEC filters sequence errors for formalin-fixed and paraffin-embedded samples |
制限公開データの利用者一覧
制限公開データの利用実績はありません。