研究 ID
hum0300-v1リリース情報
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研究題目
がんの全ゲノム・全エキソンシークエンス解析
研究概要
- 目的
- 次世代シーケンサーを始めとする種々のゲノム解析手法により同定されるゲノム・エピゲノム異常やCopy number variant（CNV）の異常、遺伝子発現異常などを併せた統合的Omics解析によって、がんの原因遺伝子や主要シグナル伝達経路を明らかにし、がん病態を包括的に理解するとともに画期的ながん分子診断法の開発ならびに治療標的分子の同定を行うこと。
- 研究方法
- 全エクソンシーケンスおよびRNA-seq
- 対象
- 全エクソン解析：食道扁平上皮がん88症例、RNA-seq解析：食道扁平上皮がん57症例（56症例に対して両解析を実施）
- URL
- N/A
データセット
| カート | データセット ID | データの種類 | 解析手法 | アクセス制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|---|---|
| JGAD000481 | NGS（Exome、RNA-seq） |
| 制限公開（Type I） | 2021-11-30 |
提供者
- 研究代表者
- 稲澤 譲治
- 所属機関
- 東京医科歯科大学 難治疾患研究所 分子細胞遺伝
研究プロジェクト情報
研究プロジェクト情報はありません。
助成金情報
| 科研費・助成金名 | 研究課題名 | 研究課題番号 |
|---|---|---|
科学研究費助成事業 新学術領域研究（研究領域提案型） | がん細胞文脈のシステム的統合理解による新たながん診断・治療概念の確立 |
|
日本医療研究開発機構（AMED） 次世代がん研究シーズ戦略的育成プログラム（P-DIRECT） | 食道扁平上皮がんの新規治療標的分子と診断バイオマーカーの同定 |
|
日本医療研究開発機構（AMED） オーダーメイド医療の実現プログラム | ゲノム網羅的解析情報を基盤とするオーダーメイドがん医療実現のための開発研究 |
|
東京医科歯科大学 難治疾患共同研究拠点 | N/A | N/A |
関連論文
| タイトル | DOI | データセット ID |
|---|---|---|
Integrative genome-wide analyses reveal the transcriptional aberrations in Japanese esophageal squamous cell carcinoma |
制限公開データの利用者一覧
| 研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | データ利用期間 | データセット ID |
|---|---|---|---|---|---|
| 浜田 道昭 | 浜田研究室, 理工学術院, 早稲田大学 | 日本 | RNA標的創薬データベースの構築 | 2023-01-05 – 2027-10-31 | |
| 藤井 誠志 | 分子病理学, 横浜市立大学 | 日本 | 多臓器に跨る扁平上皮癌におけるPD L1 免疫組織化学染色の精度管理と染色態度の生物学的意義の解明に関する観察研究 | 2025-10-07 – 2026-07-23 |