研究 ID
hum0299-v1リリース情報
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研究題目
ロングリードシークエンサーを用いたがん突然変異の染色体背景の解析
研究概要
- 目的
- ナノポアシークエンサーPromethIONの新たなプラットフォームQ20を用いた全ゲノムシークエンスによるハプロタイプフェージング解析の精度への影響を調べる
- 研究方法
- ナノポアシークエンサーPromethIONの新たなプラットフォームQ20を用いた全ゲノムシークエンス
- 対象
- 健常白人由来B細胞株HG002（NA24385）
データセット
| カート | データセット ID | データの種類 | 解析手法 | アクセス制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|---|---|
| DRA012759 | NGS（WGS） |
| 非制限公開 | 2021-12-01 |
提供者
- 研究代表者
- 鈴木 穣
- 所属機関
- 東京大学大学院 新領域創成科学研究科 メディカル情報生命専攻 生命システム観測分野
研究プロジェクト情報
研究プロジェクト情報はありません。
助成金情報
| 科研費・助成金名 | 研究課題名 | 研究課題番号 |
|---|---|---|
科学研究費助成事業 新学術領域研究 | 上皮内肺がん等の全ゲノムシークエンス解析による新規ドライバー遺伝子の同定 |
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科学研究費助成事業 新学術領域研究 | ロングリードによる肺がんゲノム構造変異とDNAメチル化状態の統合解明 |
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科学研究費助成事業 新学術領域研究 | 先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム |
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日本医療研究開発機構（AMED） 次世代がん医療創生研究事業（P-CREATE） | ロングリード技術を駆使した非小細胞肺癌におけるがんゲノム多様性・進化に関する研究 |
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日本医療研究開発機構（AMED） 次世代がん医療創生研究事業（P-CREATE） | 受動喫煙により惹起される肺がんゲノム変異の多様性の理解と治療方針の策定 |
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関連論文
| タイトル | DOI | データセット ID |
|---|---|---|
Phasing analysis of lung cancer genomes using a long read sequencer |