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NBDC Research ID:hum0294-v1
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研究題目

腫瘍浸潤T細胞サブセットのシングルセル解析

研究概要

目的: 「切除不能局所進行食道扁平上皮癌を対象とした化学放射線療法後の逐次治療としてのアテゾリズマブ単独療法の安全性及び有効性を検討する多施設共同第Ⅱ相臨床相試験」に付随するバイオマーカーの探索研究 (通称: TENERGY-TR) に参加した食道がん患者の治療前の腫瘍と正常細胞のwhole exome sequencing (WES) 解析と、治療前、放射線化学療法後、アテゾリズマブ投与後の3点の腫瘍生検検体のRNA-seq解析を実施し、治療効果予測バイオマーカー探索につなげること

研究方法: 各時点で取得した凍結腫瘍サンプルまたは血液サンプルを対象に、AllPrep DNA/RNA Mini kit (Qiagen) を用いてDNA/RNAを抽出し、WESならびにRNA-seq解析を実施した。

対象: TENERGY-TRに参加した食道がん28症例。

  • WES: 治療前の腫瘍組織 (27検体) と正常組織 (27検体) のペア、
  • RNA-seq: 治療前 (28検体) 、放射線化学療法後 (25検体) 、アテゾリズマブ投与後 (25検体) の3点の腫瘍生検検体

データセット一覧

データセット ID
アクセス制限
データの種類
公開日
JGAD000841制限公開(Type I)NGS(Exome、RNA-seq)2024-05-29

提供者情報

    研究代表者
    熊谷 尚悟
    所属機関名
    国立がん研究センター 先端医療開発センター 免疫トランスレーショナル分野

研究プロジェクト情報

研究プロジェクト名
URL
データなし

助成金情報

科研費・助成金名
タイトル
研究課題番号
日本医療研究開発機構 (AMED) 革新的がん医療実用化研究事業切除不能局所進行食道扁平癌を対象とした化学放射線療法後の逐次治療としての抗PD-1抗体薬療法の安全性・有効性・proof-of-concept (POC) を検討する多施設共同臨床第Ib/II相試験
  • JP21ck0106420

関連論文

タイトル
DOI
利用データID
Atezolizumab monotherapy following dCRT indicated a promising cCR rate in patients with unresectable locally advanced esophageal squamous cell carcinoma (EPOC1802)https://doi.org/10.1200/jco.2023.41.4_suppl.416

制限公開データの利用者一覧

研究代表者
所属機関
国・州名
研究題目
データ利用期間
利用データID
浜田道昭Waseda UniversityJapanRNA標的創薬データベースの構築2023-01-052027-10-31