データセット ID
JGAD000841
- データの種類
- NGS(Exome、RNA-seq)
- アクセス制限
- 制限公開(Type I)
- 総データ量
- 975 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0294
- 公開日
- 2024-05-29
- 更新日
- 2024-05-29
- DDBJ Search
- JGAD000841 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000708 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- 食道がん(ICD10:C159):27症例
治療前の腫瘍組織:27検体
非腫瘍組織(血液):27検体 - 健康状態罹患
- 対象者数27 (人数)
- 疾患
- 食道がん
- 試料説明
- 腫瘍組織および非腫瘍組織(血液)から抽出したDNA
- 組織末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- SureSelect Human All Exon V6
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq X
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 151 bp
RNA-seq
- 材料と対象者
- 食道がん(ICD10:C159):28症例
治療前の腫瘍組織:28検体
放射線化学療法後の腫瘍組織:25検体
アテゾリズマブ投与後の腫瘍組織:25検体 - 健康状態罹患
- 対象者数28 (人数)
- 疾患
- 食道がん
- 試料説明
- 腫瘍組織から抽出したRNA
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- TruSeq RNA Exome
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq X
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 101 bp