研究 ID
hum0273-v1リリース情報
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研究題目
乳癌の発生、進展に関する分子病理学的研究
研究概要
- 目的
- 乳がんは多様な形態を示し、特に変異や遺伝子発現プロファイルが異なる様々な細胞型を持つことを特徴としている。管腔がんと小葉がんの両方の表現型からなる腫瘍におけるがん細胞のクローン関係を明らかにする。
- 研究方法
- サンプルDNAを製造業者のプロトコルに従って、Ion Torrentプラットフォーム（Thermo Fisher SCIENTIFIC）上のIon AmpliSeq Comprehensive Cancer Panelを用いて、アンプリコン配列決定に使用した。このパネルは、409個のがん関連遺伝子のすべてのエクソンをカバーする約16,000個のプライマー対から構成されている。DNA（120 ng）を使用して、IonXpressバーコードされたアダプターを用いてライブラリーを調製し、イオンチップを用いたシーケンシングには、イオンプロトンシーケンサー（Thermo Fisher SCIENTIFIC）を用いた。
- 対象
- 小葉がんおよび乳管がん併存2症例の腫瘍組織ならびに周辺の非腫瘍組織からレーザーマイクロダイセクションにより採取した合計9検体
- URL
- N/A
データセット
| カート | データセット ID | データの種類 | 解析手法 | アクセス制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|---|---|
| JGAD000411 | NGS（Amplicon-seq） |
| 制限公開（Type I） | 2021-08-18 |
提供者
- 研究代表者
- 増田 しのぶ
- 所属機関
- 日本大学医学部 病態病理学系 腫瘍病理学分野
研究プロジェクト情報
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助成金情報
| 科研費・助成金名 | 研究課題名 | 研究課題番号 |
|---|---|---|
科学研究費助成事業 基盤研究（C） | 組織型が混在する乳癌のミトコンドリアDNA変異解析による癌細胞系譜の解明 |
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関連論文
| タイトル | DOI | データセット ID |
|---|---|---|
Phylogenetic analysis of combined lobular and ductal carcinoma of the breast |
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