研究 ID
hum0160-v1リリース情報
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最新バージョン (v2)研究題目
シークエンス解析によるがんゲノム研究：食道がん
研究概要
- 目的
- 日本人の食道がんにおけるゲノム変異を探索する
- 研究方法
- 食道がん切除切片における非腫瘍組織（正常組織）および腫瘍組織より抽出したDNAを使用したNGSライブラリーを作成後、Illumina HiSeq 2000/2500/X Fiveにて塩基配列を決定する。
- 対象
- 食道がん患者の非腫瘍組織および腫瘍組織のDNA
- URL
- N/A
データセット
データセットの一覧はこのバージョンのものですが、各データセットの内容は現在のものを表示しています。
| カート | データセット ID | データの種類 | 解析手法 | アクセス制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|---|---|
| JGAD000233 | NGS（WGS） |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000405 | NGS（WGS）のbam/gvcfデータ |
| 制限公開（Type I） | 2021-05-25 |
提供者
- 研究代表者
- 中川 英刀
- 所属機関
- 理化学研究所 生命医科学研究センター
研究プロジェクト情報
研究プロジェクト情報はありません。
助成金情報
助成金情報はありません。
関連論文
関連論文はありません。
制限公開データの利用者一覧
| 研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | データ利用期間 | データセット ID |
|---|---|---|---|---|---|
| 山本 雅之 | 東北メディカル・メガバンク機構, 東北大学 | 日本 | 日本人全ゲノムデータベースの構築 | 2019-06-24 – 2022-04-15 | |
| 白石 航也 | ゲノム生物学研究分野, 国立研究開発法人国立がん研究センター研究所 | 日本 | ゲノム解析に基づく宿主並びに腫瘍における免疫応答ネットワーク機構の解明 | 2019-08-05 – 2029-03-31 |