hum0112 のリリース情報
hum0112-v1
2017-12-14- このリリースで追加されたデータセット
- リリースノート
- NGS（PBAT-seq）
ヒト胎盤幹細胞より抽出したDNAを用いたPBAT-seq解析の結果をfastqファイルにて提供する。Post-Bisulfite Adaptor-Tagging（PBAT）法によりライブラリを作製し、Illumina [HiSeq 1500]によりシングルエンドシークエンシングを行っている（101 bp）。
NGS（ChIP-seq）
ヒト胎盤幹細胞より抽出したDNAを用いたChIP-seq解析の結果をfastqファイルにて提供する。抗H3K4me3, H3K4me1, H3K9me3, H3K27ac, H3K27me3, H3K36me3抗体を用いて免疫沈降後Ovation Ultralow System V2 kit (NuGEN)を用いてChIP-seqライブラリを作製し、Illumina [HiSeq 2500]によりペアエンドシークエンシングを行っている（126 bp）。
NGS（RNA-seq）
ヒト胎盤幹細胞より抽出したmRNAを用いたRNA-seq解析の結果をfastqファイルにて提供する。TruSeq Stranded mRNA LT Sample Prep Kit (Illumina)を用いてライブラリを作製し、Illumina [HiSeq 2500]によりペアエンドシークエンシングを行っている（101 bp）。
NGS（miRNA-seq）
ヒト胎盤幹細胞より抽出したRNAを用いたmiRNA-seq解析の結果をfastqファイルにて提供する。NEBNext Small RNA Library Prep Set for Illumina (New England Biolabs)を用いてライブラリを作製し、Illumina [HiSeq 1500]によりシングルエンドシークエンシングを行っている（64 bp）。