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NBDC ヒトデータベース

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システムメンテナンスに伴い、以下の日程で、NBDCヒトデータベース申請システムならびにヒトデータ審査委員会による審査が停止いたします。
停止期間：2026年10月5日(月) 9:00 ～ 10月7日(水) 15:00
ご迷惑をおかけしますが、どうぞ宜しくお願いいたします。

現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

研究 ID

hum0096-v1リリース情報

このページは過去のバージョン (v1) です。最新のバージョンは v2 です。
最新バージョン (v2)

研究題目

造血器腫瘍における遺伝子異常の網羅的解析（小児T細胞性急性リンパ性白血病）

研究概要

目的
多数の小児T細胞性急性リンパ芽球性白血病（小児T-ALL）検体について、次世代シーケンサーを用いた種々の遺伝子解析技術により、疾患発症の原因となる遺伝子異常をゲノムワイドに同定し、解析する。
研究方法
小児T-ALL123例の検体のRNA-seq解析を行い、融合遺伝子を同定し、発現データの解析をする。うち、79例に対してDNAメチル化アレイ解析を行い、発現データと統合的に解析をする。
対象
小児T-ALL 123症例
URL
N/A

データセット

データセットの一覧はこのバージョンのものですが、各データセットの内容は現在のものを表示しています。

カートデータセット IDデータの種類解析手法アクセス制限公開日
JGAD000090NGS（RNA-seq）
  • RNA-seq
制限公開（Type I）2020-09-28

提供者

研究代表者
滝田 順子
所属機関
東京大学大学院 医学系研究科 生殖・発達・加齢医学専攻 小児医学講座

研究プロジェクト情報

研究プロジェクト情報はありません。

助成金情報

科研費・助成金名研究課題名研究課題番号
日本医療研究開発機構（AMED） 次世代がん医療創生研究事業（P-CREATE）
分子プロファイリングを基盤とした小児期からAYA世代に発症する難治がんの新規治療法 の開発
  • JP16cm0106509
科学研究費助成事業 基盤研究（B）
マルチオミックス情報を基盤とした難治性小児がんに対する新規克服法の開発
  • 17H04224

関連論文

タイトルDOIデータセット ID
Recurrent PU.1 (SPI1) fusions in high-risk pediatric T cell acute lymphoblastic leukemia
https://doi.org/10.1038/ng.3900 (新しいタブで開きます)
DNA methylation-based classification reveals difference between pediatric T-cell acute lymphoblastic leukemia and normal thymocytes
https://doi.org/10.1038/s41375-019-0626-2 (新しいタブで開きます)

制限公開データの利用者一覧

研究代表者所属機関国・州名研究題目データ利用期間データセット ID
Jinyan HuangState Key Laboratory Of Medical Genomics, Rui-jin Hospital中国Comparing analysis adult and Pediatric B-cell Acute Lymphoblastic Leukemia2017-07-19 – 2023-07-13
Olivier BERNARDInstitut Gustave RoussyフランスNormal and malignant hematopoiesis (Hématopoiese normale et pathologique)2017-09-14 – 2021-03-19
Jun YangDepartment of Pharmaceutical Science, St. Jude Children's Research Hospitalアメリカ合衆国 (テネシー州)GENOMICS OF ANTILEUKEMIC DRUG SENSITIVITY IN ALL2019-04-11 – 2022-01-26
Charles MullighanPathology Department, St. Jude Children's Research Hospitalアメリカ合衆国 (テネシー州)Genomic analysis of acute lymphoblastic leukemia2019-10-11 – 2024-12-05
Takaomi SandaCancer Science Institute of Singapore, National University of SingaシンガポールSequencing and Expression Analyses in T-Cell Leukemia Using Publicly-Available Datasets2020-07-14 – 2024-09-30
Charles de BockChildren's Cancer Institute, University of New South Walesオーストラリア (ニューサウスウェールズ州)Elucidating the role of the TCF7-SPI1 fusion in T cell acute lymphoblastic leukemia2020-08-17 – 2021-08-18
Jinyan HuangZhejiang University School of Medicine, 79 Qingchun Road, Hangzhou, 310003, Zhejiang, China. Biomedical big data center, the First Affiliated Hospital, Zhejiang University中国Comprehensive analysis of alternative splicing in malignant tumors2022-03-15 – 2024-01-01
Chengyu LiangThe Wistar instituteアメリカ合衆国 (ペンシルベニア州)Oncogenic mechanism of T-cell lymphoblastic leukemia2022-01-14 – 2027-11-22
安田 貴彦臨床研究センター, 名古屋医療センター日本造血器疾患の分子病態の解明ならびに有効かつ安全性の高い治療法開発を目指した基盤研究2022-01-13 – 2030-03-31
浜田 道昭浜田研究室, 理工学術院, 早稲田大学日本RNA標的創薬データベースの構築2023-01-05 – 2027-10-31