研究 ID
hum0085-v1リリース情報
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最新バージョン (v2)研究題目
胸腹部腫瘍の長期治療成績に関する分子生物学的研究 / 環境因子が関与する腫瘍のゲノム解析
研究概要
- 目的
- 悪性中皮腫はアスベスト曝露が主要因となる極めて予後不良の悪性腫瘍である。その治療成績の向上のためには腫瘍組織における変異やゲノム構造異常等、分子生物学的特性を把握し、早期診断、治療標的分子の同定が必要である。近年の家族性悪性中皮腫の報告からも、遺伝的背景と易罹患性との関連研究も重要である。悪性中皮腫の罹患者数が他の腫瘍に比べて少ないため、解析対象は日本人だけでなく、悪性中皮腫罹患者数が多い米国人やトルコ人検体も解析し、人種にかかわらず悪性中皮腫患者に共通するゲノム特性を抽出することを目的とする。
- 研究方法
- 3p21を対象とした高解像度アレイCGH、および、次世代シーケンス解析（Whole Genome Sequencing [WGS]、Target Capture Sequencing、Whole Exome Sequencing）
- 対象
- 悪性中皮腫患者の腫瘍組織および末梢血（非腫瘍組織）から抽出したDNA
- URL
- N/A
データセット
データセットの一覧はこのバージョンのものですが、各データセットの内容は現在のものを表示しています。
| カート | データセット ID | データの種類 | 解析手法 | アクセス制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|---|---|
| JGAD000116 | アレイCGH NGS（WGS） NGS（Target Capture） |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 |
提供者
- 研究代表者
- 大村谷 昌樹
- 所属機関
- 兵庫医科大学 遺伝学
研究プロジェクト情報
研究プロジェクト情報はありません。
助成金情報
| 科研費・助成金名 | 研究課題名 | 研究課題番号 |
|---|---|---|
科学研究費助成事業 基盤研究（C） | 日本人悪性中皮腫に高頻度で見出された3p領域欠損の機能解析と診断への応用 |
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科学研究費助成事業 基盤研究（C） | 日本人悪性中皮腫におけるゲノム不安定性に基づく治療戦略の基礎的検討 |
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科学研究費助成事業 基盤研究（C） | 環境癌における3p21領域ゲノム構造異常の詳細解析 |
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科学研究費助成事業 基盤研究（C） | 悪性中皮腫の易罹患性を生殖細胞系列ゲノムで診断する方法の考案 |
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Grant-in-Aid for Researchers from Hyogo College of Medicine | 悪性中皮腫易罹患性に寄与するゲノム多型/変異を探索する国際共同研究-人種やアスベスト暴露多寡に依存しない罹患寄与遺伝子の探索- |
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Grant-in-Aid for Researchers from Hyogo College of Medicine | 本学悪性中皮腫患者で検出される生殖細胞系列変異の疾患への寄与の検証 |
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関連論文
| タイトル | DOI | データセット ID |
|---|---|---|
High-density array-CGH with targeted NGS unmask multiple noncontiguous minute deletions on chromosome 3p21 in mesothelioma | ||
A Subset of Mesotheliomas With Improved Survival Occurring in Carriers of BAP1 and Other Germline Mutations |
制限公開データの利用者一覧
| 研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | データ利用期間 | データセット ID |
|---|---|---|---|---|---|
| 白石 航也 | ゲノム生物学研究分野, 国立研究開発法人国立がん研究センター研究所 | 日本 | ゲノム解析に基づく宿主並びに腫瘍における免疫応答ネットワーク機構の解明 | 2019-08-05 – 2029-03-31 | |
| 有田 正規 | 生命情報・DDBJ センター, 国立遺伝学研究所 | 日本 | DDBJ センターと NBDC による JGA 解析データの提供 | 2021-10-07 – 2030-03-31 |