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NBDC ヒトデータベース
NBDC Research ID:hum0034-v1
リリース情報
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研究題目

小細胞肺癌の網羅的ゲノム解析による 新たな治療標的の探索を目指した研究

研究概要

目的: 難治療性の小細胞肺がん (small cell lung cancer: SCLC) を対象として網羅的ゲノム解析を実施し、新たな治療標的を発見することにより新しい分子標的治療法の開発に結びつけること

研究方法: ホルマリン固定ないしメタノール固定された組織より抽出したゲノムDNA断片から SureSelect Human All Exon V4+UTRs Kit (Agilent Technologies) を用いて全エクソンを含む71Mb領域をキャプチャし、Illumina HiSeq 2000により100-bpペアエンドシークエンスを行った。

対象: 1992-2012年に国立がん研究センター東病院 呼吸器内科の肺がんデータベースに登録された小細胞肺がん約1042例のうち、手術・生検が施行され、小細胞肺がんの病理診断が確定し、全エクソンシークエンスに必要なゲノムDNAが抽出可能だった51例

データセット一覧

データセット ID
アクセス制限
データの種類
公開日
JGAD000037制限公開(Type I)Exome(NGS)2020-09-28

提供者情報

    研究代表者
    後藤 功一
    所属機関
    国立がん研究センター 東病院呼吸器内科

研究プロジェクト情報

研究プロジェクト名
URL
難治性の小細胞肺がんを対象とした網羅的ゲノム解析による新しい分子標的治療法の開発

助成金情報

科研費・助成金名
タイトル
研究課題番号
科学研究費助成事業 基盤研究 (B)小細胞肺癌のゲノムワイド網羅的解析による発生分子基盤の解明と治療標的の探索
  • 24300346
科学研究費助成事業 若手研究 (B)大細胞神経内分泌肺癌の標的遺伝子解析による新しい治療法の探索
  • 26870876
国立がん研究センターがん研究開発費がん研究分野における生物統計学・情報学研究基盤の構築に関する研究
  • 23-A-8
国立がん研究センターがん研究開発費がん治療の早期開発試験およびその研究体制確立に関する研究
  • 23-A-15
日本医療研究開発機構 (AMED) 次世代がん研究シーズ戦略的育成プログラム (P-DIRECT)小細胞肺がんの全ゲノム網羅的解析による治療標的の探索
  • JP15cm0106063

関連論文

タイトル
DOI
データセット
Therapeutic priority of the PI3K/AKT/mTOR pathway in small cell lung cancers as revealed by a comprehensive genomic analysis.https://doi.org/10.1097/JTO.0000000000000250

制限公開データの利用者一覧

研究代表者
所属機関
国・州名
研究題目
データ利用期間
利用データID
Berns AntonThe Netherlands Cancer InstituteNetherlandsIntegrative analysis of small cell lung cancer2016-03-302017-09-12
中岡博史Kagoshima University Graduate School of Medical and Dental SciencesJapan大規模シーケンスデータを用いた乳がん関連遺伝子における活性低下型変異の研究2022-08-172026-07-23