データセット ID
JGAD000037
- データの種類
- Exome（NGS）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 4.0 TB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0034
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-09-28
- DDBJ Search
- JGAD000037 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000037 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- 1992-2012年に国立がん研究センター東病院 呼吸器内科の肺がんデータベースに登録された小細胞肺がん約1042例のうち、手術・生検が施行され、小細胞肺がんの病理診断が確定し、全エクソンシークエンスに必要なゲノムDNAが抽出可能だった51例
- 健康状態罹患
- 対象者数51 (人数)
- 試料説明
- ホルマリン固定ないしメタノール固定された組織より抽出したゲノムDNA
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- SureSelect Human All Exon V4 + UTRs
- 断片化
- 超音波断片化（Covaris S220）
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 100 bp
- 表現型データの有無
- あり