研究題目
関節リウマチ患者及び健常人における HLA領域の塩基配列比較解析
研究概要
目的: HLA遺伝子 (HLA-A, -C, -B, -DRB1, -DQB1および-DPB1) におけるHLAアレル完全長塩基配列 (約3kb〜14kb) を決定する
研究方法: Long range PCRにより目的領域を増幅し、Illumina社のMiSeqにより塩基配列を解析する
対象: 複数集団由来セルライン: 33名
2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします
現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです
NBDC Research ID:hum0003-v1
リリース情報 データセット一覧
データセット ID | アクセス制限 | データの種類 | 公開日 | |
|---|---|---|---|---|
| DRA000908 | 非制限公開 | NGS (HLAアレルの塩基配列決定) | 2013-07-01 | |
提供者情報
- 研究代表者
- 井ノ上 逸朗
- 所属機関名
- 国立遺伝学研究所 人類遺伝研究部門
研究プロジェクト情報
研究プロジェクト名 | URL |
|---|---|
| データなし | |
助成金情報
科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
|---|---|---|
| 科学研究費助成事業 新学術領域研究 (研究領域提案型) | HLA進化と疾病 リシークエンシングによるHLAゲノム多様性解析 |
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| 公益財団法人 武田科学振興財団 | 医学系研究奨励 (2011年度) | |
| 科学研究費助成事業 新学術領域研究 (研究領域提案型) | ゲノム科学の総合的推進に向けた大規模ゲノム情報生産・ 高度情報解析支援 |
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関連論文
タイトル | DOI | 利用データID |
|---|---|---|
| Phase-defined complete sequencing of the HLA genes by next-generation sequencing. | https://doi.org/10.1186/1471-2164-14-355 | |
制限公開データの利用者一覧
研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | データ利用期間 | 利用データID |
|---|---|---|---|---|---|
| データなし | |||||