NBDC Research ID: hum0502.v1
研究内容の概要
目的： 子宮頸がんの凍結組織検体を用いたトランスクリプトーム解析を実施することで、網羅的な遺伝子発現プロファイルを明らかにすること
方法： 腫瘍組織から抽出したRNAを用いたRNAシークエンス解析を実施した
対象： 国立がんセンター中央病院において外科的治療を受けた子宮頸がん29症例
URL： https://ncc.bvits.com/rinri/publish_document.aspx?ID=38052
| データID | 内容 | 制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|
| JGAS000803 | NGS（RNA-seq） | 制限公開（Type I） | 2025/06/05 |
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分子データ
| 対象 |
子宮頸がん（ICD10：C539）：29症例 腫瘍組織：29検体 |
| 規模 | RNA-seq |
| 対象領域（Target Captureの場合） | - |
| Platform | Illumina [NovaSeq 6000] |
| ライブラリソース | 腫瘍組織から抽出したRNA |
| 検体情報（購入の場合） | - |
| ライブラリ作製方法（キット名） | TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit |
| 断片化の方法 | 超音波断片化（Covaris） |
| ライブラリ構築方法 | Paired-end |
| リード長（除：バーコード、アダプタ、プライマー、リンカー） | 150 bp x 2 |
| Japanese Genotype-phenotype Archive Dataset ID | JGAD000945 |
| 総データ量 | 144.9 GB（fastq） |
| コメント（利用にあたっての制限事項） | NBDC policy |
提供者情報
研究代表者：白石 航也
所 属 機 関：国立がん研究センター研究所 臨床ゲノム解析部門
プロジェクト/研究グループ名：体細胞ゲノム解析に基づく子宮頸がんの本態解明・治療標的の同定を目指す研究
URL： https://ncc.bvits.com/rinri/publish_document.aspx?ID=38052
科研費/助成金（Research Project Number）：
| 科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
|---|---|---|
| 科学研究費助成事業 基盤研究（C） | 子宮頸がんに対する治療標的となりうる新規ゲノムプロファイリングの同定 | 22K09563 |
関連論文
| タイトル | DOI | データID | |
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制限公開データの利用者一覧
| 研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | 利用データID | 利用期間 |
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