NBDC Research ID: hum0307.v1
研究内容の概要
目的： 試験１「健常者における皮膚物性および皮膚成分の解析」および試験２「アトピー性皮膚炎患者における皮膚成分の解析」において実施したRNA発現量を解析し、健常者とAD患者間の皮脂RNAの違いを解明すること。
方法： 皮脂中のRNA発現量のAmpliSeq Transcriptomeを用いたRNA-seq解析
対象： 健常男性29名、および、アトピー性皮膚炎男性患者30症例
| データID | 内容 | 制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|
| JGAS000416 | NGS（RNA-seq） | 制限公開（Type I） | 2022/03/11 |
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分子データ
| 対象 |
健常男性：29名 男性のアトピー性皮膚炎（ICD10：L20）：30症例 |
| 規模 | RNA-seq |
| 対象領域（Target Captureの場合） | - |
| Platform | Thermo Fisher Scientific [Ion S5] |
| ライブラリソース | 顔面の皮脂から抽出したmRNA |
| 検体情報（購入の場合） | - |
| ライブラリ作製方法（キット名） | Ion AmpliSeq Transcriptome Human Gene Expression Kit |
| 断片化の方法 | - |
| ライブラリ構築方法 | Single-end |
| リード長（除：バーコード、アダプタ、プライマー、リンカー） | 110 bp |
| Japanese Genotype-phenotype Archive Dataset ID | JGAD000533 |
| 総データ量 | 261 GB（bam） |
| コメント（利用にあたっての制限事項） | NBDC policy |
提供者情報
研究代表者： 井上 高良
所 属 機 関： 花王株式会社 生物科学研究所
プロジェクト/研究グループ名： 皮脂RNAプロジェクト
科研費/助成金（Research Project Number）：
| 科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
|---|---|---|
| - | - | - |
関連論文
| タイトル | DOI | データID | |
|---|---|---|---|
| 1 | Non-invasive human skin transcriptome analysis using mRNA in skin surface lipids | doi: 10.1038/s42003-022-03154-w | JGAD000533 |
| 2 |
制限公開データの利用者一覧
| 研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | 利用データID | 利用期間 |
|---|---|---|---|---|---|
| 浜田 道昭 | 早稲田大学 理工学術院 | 日本 | RNA標的創薬データベースの構築 | JGAD000533 | 2022/12/26-2025/03/31 |
