NBDC Research ID: hum0247.v1
研究内容の概要
目的： ヒトメラノーマ細胞より樹立したtumor infiltrating lymphocyte（TIL）を用いた細胞治療法の確立
方法： TILのもとになったメラノーマ腫瘍細胞および末梢血peripheral blood mononuclear cells（PBMC）のエクソームシークエンス
対象： 悪性黒色腫の腫瘍組織と非腫瘍組織
| データID | 内容 | 制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|
| JGAS000249 | NGS（Exome） | 制限公開（Type I） | 2021/01/04 |
| DRA010773 | NGS（Exome） | 非制限公開 | 2021/01/04 |
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分子データ
| 対象 |
悪性黒色腫（ICD10：C43.3、C43.7）：3症例 腫瘍組織：3検体 非腫瘍組織（PBMC）：3検体 |
| 規模 | Exome |
| 対象領域（Target Captureの場合） | - |
| Platform | Illumina [HiSeq 1500] |
| ライブラリソース | 悪性黒色腫の腫瘍組織およびPBMCから抽出したDNA |
| 検体情報（購入の場合） | - |
| ライブラリ作製方法（キット名） | SureSelect Human All Exon Kit V6 |
| 断片化の方法 | 超音波断片化（Covaris） |
| ライブラリ構築方法 | Paired-end |
| リード長（除：バーコード、アダプタ、プライマー、リンカー） | 100 bp |
| Japanese Genotype-phenotype Archive Dataset ID / DDBJ Sequence Read Archive ID |
非腫瘍組織：JGAD000349 腫瘍組織：DRA010773 |
| 総データ量 |
非腫瘍組織：25 GB（fastq） 腫瘍組織：15 GB（bam [ref：hg19]） |
| コメント（利用にあたっての制限事項） | NBDC policy |
提供者情報
研究代表者： 岩田 卓
所 属 機 関： 慶應義塾大学医学部 産婦人科学教室
プロジェクト/研究グループ名： -
科研費/助成金（Research Project Number）：
| 科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
|---|---|---|
| 日本医療研究開発機構（AMED） 革新的がん医療実用化研究事業 | 進行期悪性黒色腫(末端黒子型)に対する非骨髄破壊的前処置併用での腫瘍浸潤Tリンパ球輸注療法の安全性試験 | JP17ck0106158 |
関連論文
| タイトル | DOI | データID | |
|---|---|---|---|
| 1 | Pilot study of adoptive cell therapy using cultured tumor infiltrating lymphocytes for Japanese melanoma patients refractory to immune-checkpoint inhibitors | doi: 10.1111/cas.15009 |
JGAD000349 DRA010773 |
| 2 |
制限公開データの利用者一覧
| 研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | 利用データID | 利用期間 |
|---|---|---|---|---|---|
| 山本 拓也 | 国立研究開発法人 医薬基盤・健康・栄養研究所 プレシジョン免疫プロジェクト | 日本 | 新規がん抗原の同定に基づく消化器がんおよび悪性黒色腫（メラノーマ）に対するワクチン開発基盤研究 | JGAD000349 | 2024/11/12-2025/09/01 |
