NBDC Research ID: hum0231.v1
研究内容の概要
目的： iPS細胞を用いた疾患研究の対照とするため、健常人からiPS細胞を樹立する。試料提供者（ドナー）のゲノムを解析し、疾患関連変異の有無を確認する。
方法： ドナーから末梢血単核球を採取し、Whole Exome Seqencing解析を実施する
対象： 健診受診者
| データID | 内容 | 制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|
| JGAS000287 | NGS（Exome） | 制限公開（Type I） | 2024/07/22 |
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分子データ
| 対象 | 健常人：120名 |
| 規模 | Exome |
| 対象領域（Target Captureの場合） | - |
| Platform | Illumina [HiSeq 2500] |
| ライブラリソース | 末梢血単核球から抽出したDNA |
| 検体情報（購入の場合） | - |
| ライブラリ作製方法（キット名） | SureSelect Human All Exon V6 |
| 断片化の方法 | 超音波断片化（Covaris） |
| ライブラリ構築方法 | Paired-end |
| リード長（除：バーコード、アダプタ、プライマー、リンカー） | 100 bp |
| Japanese Genotype-phenotype Archive Dataset ID | JGAD000393 |
| 総データ量 | 552.1 GB（fastq） |
| コメント（利用にあたっての制限事項） | NBDC policy |
提供者情報
研究代表者： 齋藤 潤
所 属 機 関： 京都大学iPS細胞研究所
プロジェクト/研究グループ名： -
科研費/助成金（Research Project Number）：
| 科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
|---|---|---|
| 日本医療研究開発機構（AMED） 疾患特異的iPS細胞の利活用促進・難病研究加速プログラム | 疾患特異的iPS細胞樹立促進のための基盤形成 | JP16bm0609001 |
| 日本医療研究開発機構（AMED） 疾患特異的iPS細胞の利活用促進・難病研究加速プログラム | 日本人健常人集団由来iPS細胞株の構築 | JP19bm0804001 |
| 京都大学iPS細胞研究所 iPS細胞研究基金 | - | - |
関連論文
| タイトル | DOI | データID | |
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制限公開データの利用者一覧
| 研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | 利用データID | 利用期間 |
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