NBDC Research ID: hum0231.v1

 

研究内容の概要

目的： iPS細胞を用いた疾患研究の対照とするため、健常人からiPS細胞を樹立する。試料提供者（ドナー）のゲノムを解析し、疾患関連変異の有無を確認する。

方法： ドナーから末梢血単核球を採取し、Whole Exome Seqencing解析を実施する

対象： 健診受診者

 

データID内容制限公開日
JGAS000287 NGS（Exome） 制限公開（Type I） 2024/07/22

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分子データ

JGAS000287
対象 健常人：120名
規模 Exome
対象領域（Target Captureの場合） -
Platform Illumina [HiSeq 2500]
ライブラリソース 末梢血単核球から抽出したDNA
検体情報（購入の場合） -
ライブラリ作製方法（キット名） SureSelect Human All Exon V6
断片化の方法 超音波断片化（Covaris）
ライブラリ構築方法 Paired-end
リード長（除：バーコード、アダプタ、プライマー、リンカー） 100 bp
Japanese Genotype-phenotype Archive Dataset ID JGAD000393
総データ量 552.1 GB（fastq）
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提供者情報

研究代表者： 齋藤 潤

所 属 機 関： 京都大学iPS細胞研究所

プロジェクト/研究グループ名： -

科研費/助成金（Research Project Number）：

科研費・助成金名タイトル研究課題番号
日本医療研究開発機構（AMED） 疾患特異的iPS細胞の利活用促進・難病研究加速プログラム 疾患特異的iPS細胞樹立促進のための基盤形成 JP16bm0609001
日本医療研究開発機構（AMED） 疾患特異的iPS細胞の利活用促進・難病研究加速プログラム 日本人健常人集団由来iPS細胞株の構築 JP19bm0804001
京都大学iPS細胞研究所 iPS細胞研究基金 - -

 

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制限公開データの利用者一覧

研究代表者所属機関国・州名研究題目利用データID利用期間