NBDC Research ID: hum0192.v1
研究内容の概要
目的： 治療前のcell free DNA 測定によって大腸・直腸がん患者のオリゴメタスタシスに対する放射線・陽子線治療後の予後との相関を明らかにすること
方法： 放射線もしくは陽子線治療前に採取した血液検体からcell free DNA量を測定し、予後との相関関係について検討するため、放射線・陽子線治療を受けた大腸・直腸がん症例の治療前末梢血（血漿）中のcell free DNAを抽出し、がん遺伝子（circulating tumor DNA）の検出をNCCオンコパネルv2を用いて実施した。
対象： 2005年4月から2017年12月までの期間に治療を受け、治療前血液検体が保存されている大腸・直腸がん症例
| データID | 内容 | 制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|
| JGAS000196 | NGS（Target Capture） | 制限公開（Type I） | 2021/04/23 |
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分子データ
| 対象 | 大腸・直腸がん（ICD10：C18.9、C20 ）：20症例 |
| 規模 | Target Capture |
| 対象領域（Target Captureの場合） |
NCC Oncopanel v2 https://www.ncc.go.jp/jp/information/pr_release/2019/0529/index.html |
| Platform | Illumina [NovaSeq 6000] |
| ライブラリソース | 末梢血（血漿）から抽出したcell free DNA |
| 検体情報（購入の場合） | - |
| ライブラリ作製方法（キット名） | SureSelect XT HS |
| 断片化の方法 | - |
| ライブラリ構築方法 | Paired-end |
| リード長（除：バーコード、アダプタ、プライマー、リンカー） | 300 bp |
| Japanese Genotype-phenotype Archive Dataset ID | JGAD000279 |
| 総データ量 | 50 GB（fastq） |
| コメント（利用にあたっての制限事項） | NBDC policy |
提供者情報
研究代表者： 中村 匡希
所 属 機 関： 国立がん研究センター東病院 放射線治療科
プロジェクト/研究グループ名： -
科研費/助成金（Research Project Number）：
| 科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
|---|---|---|
| 科学研究費助成事業 若手研究 | オリゴメタスタシスの予後予測としてのcell free DNAの有効性検証の研究 | 18K15611 |
関連論文
| タイトル | DOI | データID | |
|---|---|---|---|
| 1 | Liquid Biopsy Cell-free DNA Biomarkers in Patients With Oligometastatic Colorectal Cancer Treated by Ablative Radiotherapy | doi: 10.21873/anticanres.14835 | JGAD000279 |
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制限公開データの利用者一覧
| 研究代表者 | 所属機関 | 利用データID | 利用期間 |
|---|---|---|---|
