NBDC Research ID: hum0191.v1
研究内容の概要
目的： 膵がん症例の腫瘍組織を用いて膵がん発症者の免疫状態をモニタリングし、予後との関連を検討する
方法： 膵がん（腫瘍組織）から抽出したRNAを用いたRNA-Seq解析データを用いた発現解析および腫瘍浸潤リンパ球予測
対象： 根治手術実施後の膵がん症例
| データID | 内容 | 制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|
| DRA008575 | NGS（RNA-seq） | 非制限公開 | 2020/06/05 |
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分子データ
| 対象 | 膵がん（ICD10：C25.9）：17症例 |
| 規模 | RNA-seq |
| 対象領域（Target Captureの場合） | - |
| Platform | Illumina [HiSeq 1500/4000] |
| ライブラリソース | 腫瘍組織から抽出したRNA |
| 検体情報（購入の場合） | - |
| ライブラリ作製方法（キット名） | - |
| 断片化の方法 | - |
| ライブラリ構築方法 | Single-end / Paired-end |
| リード長（除：バーコード、アダプタ、プライマー、リンカー） | 50bp（SE）、100bp（PE） |
| DDBJ Sequence Read Archive ID | DRA008575 |
| 総データ量 | 100 GB（fastq） |
| コメント（利用にあたっての制限事項） | NBDC policy |
提供者情報
研究代表者： 垣見 和宏
所 属 機 関： 東京大学医学部附属病院 免疫細胞治療学講座
プロジェクト/研究グループ名： -
科研費/助成金（Research Project Number）：
| 科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
|---|---|---|
| 科学研究費助成事業 基盤研究（B） | エピジェネティクスと免疫制御の併用によるネオアンチゲンを標的としたがん免疫治療 | 16H04708 |
| 科学研究費助成事業 基盤研究（C） | 遺伝子変異由来ネオエピトープを標的としたがん免疫治療の開発 | 16K07162 |
関連論文
| タイトル | DOI | データID | |
|---|---|---|---|
| 1 | NK cell and IFN signatures are positive prognostic biomarkers for resectable pancreatic cancer | doi: 10.1016/j.bbrc.2017.12.083 | DRA008575 |
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