hum0177.v1 リリース情報

Research ID公開日内容
hum0177.v1 2020/04/27 NGS(PBAT-seq、RNA-seq、ChIP-seq)

 

hum0177.v1

・PBAT-seq

このバージョンでは、悪性神経膠腫14症例の腫瘍組織および細胞株1種から抽出したDNAを用いたPBAT-seq解析の結果をfastqファイルにて提供する。TACS ligation-mediated PBAT(Miura F, Nucleic Acids Res. 2019)によるライブラリ作製後、Hiseq X Ten(Illumina)によりシークエンシングを行っている。

 

・RNA-seq

このバージョンでは、悪性神経膠腫5症例の腫瘍組織および細胞株1種から抽出したRNAを用いたRNA-seq解析の結果をfastqファイルにて提供する。TruSeq stranded mRNA Kitによるライブラリ作製後、NovaSeq 6000(Illumina)によりシークエンシングを行っている。

 

・ChIP-seq

このバージョンでは、悪性神経膠腫細胞株1種から抽出したDNAを用いたChIP-seq解析の結果をfastqファイルにて提供する。SMARTer ThruPLEX DNA-seq Kitおよび抗H3.3抗体および抗H3.3 G34V抗体を用いた免疫沈降によりライブラリを作製し、NovaSeq 6000(Illumina)によりシークエンシングを行っている。

 

Note: