hum0177.v1 リリース情報
| Research ID | 公開日 | 内容 |
|---|---|---|
| hum0177.v1 | 2020/04/27 | NGS（PBAT-seq、RNA-seq、ChIP-seq） |
hum0177.v1
・PBAT-seq
このバージョンでは、悪性神経膠腫14症例の腫瘍組織および細胞株1種から抽出したDNAを用いたPBAT-seq解析の結果をfastqファイルにて提供する。TACS ligation-mediated PBAT（Miura F, Nucleic Acids Res. 2019）によるライブラリ作製後、Hiseq X Ten（Illumina）によりシークエンシングを行っている。
・RNA-seq
このバージョンでは、悪性神経膠腫5症例の腫瘍組織および細胞株1種から抽出したRNAを用いたRNA-seq解析の結果をfastqファイルにて提供する。TruSeq stranded mRNA Kitによるライブラリ作製後、NovaSeq 6000（Illumina）によりシークエンシングを行っている。
・ChIP-seq
このバージョンでは、悪性神経膠腫細胞株1種から抽出したDNAを用いたChIP-seq解析の結果をfastqファイルにて提供する。SMARTer ThruPLEX DNA-seq Kitおよび抗H3.3抗体および抗H3.3 G34V抗体を用いた免疫沈降によりライブラリを作製し、NovaSeq 6000（Illumina）によりシークエンシングを行っている。
Note：
