NBDC Research ID: hum0168.v1
研究内容の概要
目的： 子宮腺筋症の原因遺伝子の探索
方法： 子宮腺筋症の腺筋症病変部、併発内膜症病変部、併発筋腫病変部、周辺子宮筋層、腹水中単核球、末梢血から抽出したDNAを用いた全エクソン解析
対象： 子宮腺筋症
| データID | 内容 | 制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|
| JGAS000169 | NGS（Exome） | 制限公開（Type I） | 2019/11/08 |
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分子データ
| 対象 | 子宮腺筋症（ICD10：N80.0）：51症例 |
| 規模 | Exome |
| 対象領域（Target Captureの場合） | - |
| Platform | Illumina [HiSeq 2500] |
| ライブラリソース | 子宮腺筋症の腺筋症病変部、併発内膜症病変部、併発筋腫病変部、周辺子宮筋層、腹水中単核球、末梢血から抽出したDNA |
| 検体情報（購入の場合） | - |
| ライブラリ作製方法（キット名） | NEBNext Ultra DNA library prep kit for Illumina、Agilent V6 plus custom probes |
| 断片化の方法 | 超音波断片化（Covaris） |
| ライブラリ構築方法 | Paired-end |
| リード長（除：バーコード、アダプタ、プライマー、リンカー） | 125 bp |
| Japanese Genotype-phenotype Archive Dataset ID | JGAD000247 |
| 総データ量 | 2 TB （bam [ref：hg38） |
| コメント（利用にあたっての制限事項） | NBDC policy |
提供者情報
研究代表者： 河津 正人
所 属 機 関： 国立がん研究センター研究所
プロジェクト/研究グループ名： 細胞情報学分野
科研費/助成金（Research Project Number）：
| 科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
|---|---|---|
| 科学研究費助成事業 基盤研究（C） | LCM法による子宮腺筋症凍結検体の高感度遺伝子変異検出法の確立 | 19K07708 |
関連論文
| タイトル | DOI | データID | |
|---|---|---|---|
| 1 | Uterine adenomyosis is an oligoclonal disorder associated with KRAS mutations | doi: 10.1038/s41467-019-13708-y | JGAD000247 |
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制限公開データの利用者一覧
| 研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | 利用データID | 利用期間 |
|---|---|---|---|---|---|
