NBDC Research ID: hum0148.v1
研究内容の概要
目的: 腎細胞がんの診断および治療標的遺伝子の探索
方法: 腫瘍組織から抽出したRNAを用いたRNAseqによる網羅的遺伝子発現解析
対象: がん研究会有明病院の腎がん患者由来の原発巣(43症例)並びに転移巣(24症例)の腫瘍組織
データID | 内容 | 制限 | 公開日 |
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JGAS000149 | NGS(RNA-seq) | 制限公開(Type I) | 2019/06/20 |
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分子データ
対象 |
腎がん(ICD10:C64):67症例 原発巣:43症例 転移巣:24症例 |
規模 | RNA-seq |
対象領域(Target Captureの場合) | - |
Platform | Illumina [Genome Analyzer IIx] |
ライブラリソース | 腫瘍組織から抽出したRNA |
検体情報(購入の場合) | - |
ライブラリ作製方法(キット名) | TruSeq RNA Sample Prep Kit v2 |
断片化の方法 | 熱処理 |
ライブラリ構築方法 | Single-end |
リード長(除:バーコード、アダプタ、プライマー、リンカー) | 51 bp |
Japanese Genotype-phenotype Archive Dataset ID | |
総データ量 | 67 GB(fastq) |
コメント(利用にあたっての制限事項) | NBDC policy および Cancer Research Use Only |
提供者情報
研究代表者: 湯浅 健
所 属 機 関: がん研究会有明病院・泌尿器科
プロジェクト/研究グループ名: -
科研費/助成金(Research Project Number):
科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
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科学研究費助成事業 基盤研究(C) | 腎癌における遺伝子変異・遺伝子発現を基にした治療体系確立への基礎研究 | 16K11035 |
喫煙科学研究財団 | 腎癌における遺伝子変異・発現異常を基にした治療体系確立への基礎研究 | - |
関連論文
タイトル | DOI | データID | |
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1 | ADP-ribosylation factor-like 4C is a predictive biomarker of poor prognosis in patients with renal cell carcinoma | PMID: 30906638 |
JGAD000223 JGAD000224 JGAD000225 |
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制限公開データの利用者一覧
研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | 利用データID | 利用期間 |
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