NBDC Research ID: hum0148.v1

 

研究内容の概要

目的: 腎細胞がんの診断および治療標的遺伝子の探索

方法: 腫瘍組織から抽出したRNAを用いたRNAseqによる網羅的遺伝子発現解析

対象: がん研究会有明病院の腎がん患者由来の原発巣(43症例)並びに転移巣(24症例)の腫瘍組織

 

データID内容制限公開日
JGAS000149 NGS(RNA-seq) 制限公開(Type I) 2019/06/20

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分子データ

JGAS000149

対象

腎がん(ICD10:C64):67症例

      原発巣:43症例

      転移巣:24症例

規模 RNA-seq
対象領域(Target Captureの場合) -
Platform Illumina [Genome Analyzer IIx]
ライブラリソース 腫瘍組織から抽出したRNA
検体情報(購入の場合) -
ライブラリ作製方法(キット名) TruSeq RNA Sample Prep Kit v2
断片化の方法 熱処理
ライブラリ構築方法 Single-end
リード長(除:バーコード、アダプタ、プライマー、リンカー) 51 bp
Japanese Genotype-phenotype Archive Dataset ID

JGAD000223

JGAD000224

JGAD000225

総データ量 67 GB(fastq)
コメント(利用にあたっての制限事項) NBDC policy および Cancer Research Use Only

 

提供者情報

研究代表者: 湯浅 健

所 属 機 関: がん研究会有明病院・泌尿器科

プロジェクト/研究グループ名: -

科研費/助成金(Research Project Number):

科研費・助成金名タイトル研究課題番号
科学研究費助成事業 基盤研究(C) 腎癌における遺伝子変異・遺伝子発現を基にした治療体系確立への基礎研究 16K11035
喫煙科学研究財団 腎癌における遺伝子変異・発現異常を基にした治療体系確立への基礎研究 -

 

関連論文

タイトルDOIデータID
1 ADP-ribosylation factor-like 4C is a predictive biomarker of poor prognosis in patients with renal cell carcinoma PMID: 30906638

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制限公開データの利用者一覧

研究代表者所属機関国・州名研究題目利用データID利用期間