NBDC Research ID: hum0137.v1
研究内容の概要
目的： 1型糖尿病の疾患感受性遺伝子を明らかにする。
方法： NGS解析（Target Capture）
対象： 1型糖尿病症例
| データID | 内容 | 制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|
| JGAS000144 | NGS（Target Capture） | 制限公開（Type I） | 2018/12/21 |
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分子データ
| 対象 | 1型糖尿病（ICD10：E10）：32症例 |
| 規模 | Target Capture |
| 対象領域（Target Captureの場合） |
1. chr.12: 53,551,446-53,574,693 2. chr.12: 53,585,106-53,601,000 |
| Platform | Thermo Fisher Scientific [Ion Proton] |
| ライブラリソース | 末梢血から抽出したDNA |
| 検体情報（購入の場合） | - |
| ライブラリ作製方法（キット名） | Amplicon Sequencing |
| 断片化の方法 | 酵素反応 |
| ライブラリ構築方法 | Single-end |
| リード長（除：バーコード、アダプタ、プライマー、リンカー） | 151 bp |
| Japanese Genotype-phenotype Archive Dataset ID | JGAD000213 |
| 総データ量 | 21 GB（fastq） |
| コメント（利用にあたっての制限事項） | NBDC policy |
提供者情報
研究代表者： 池上 博司
所 属 機 関： 近畿大学医学部内分泌・代謝・糖尿病内科
プロジェクト/研究グループ名： 日本糖尿病学会１型糖尿病調査研究委員会 遺伝子解析チームコアメンバー
URL： http://www.jds.or.jp/modules/study/index.php?content_id=4
科研費/助成金（Research Project Number）：
| 科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
|---|---|---|
| - |
関連論文
| タイトル | DOI | データID | |
|---|---|---|---|
| 1 | A genome-wide association study confirming a strong effect of HLA and identifying variants in CSAD/lnc-ITGB7-1 on chromosome 12q13.13 associated with susceptibility to fulminant type 1 diabetes | doi: 10.2337/db18-0314 | JGAD000213 |
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制限公開データの利用者一覧
| 研究代表者 | 所属機関 | 利用データID | 利用期間 |
|---|---|---|---|
