NBDC Research ID: hum0048.v1
研究内容の概要
目的: 国際多施設共同研究によって、ファーター乳頭部腫瘍の分子遺伝学的な特徴を明らかにし、治療法の開発に貢献する。
方法: イルミナHiSeq 2000および2500を使用し、60名のファーター乳頭部がんの全エクソン解析を実施。
対象: 臨床・病理的に診断されたファーター乳頭部腫瘍60症例(日本人28症例、米国人32症例)
データID | 内容 | 制限 | 公開日 |
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DRA004251 | NGS(Exome) | 非制限公開 | 2016/02/05 |
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分子データ
対象 | ファーター乳頭部がん:60症例(日本人28症例、米国人32症例) |
規模 | Exome |
対象領域(Target Captureの場合) | - |
Platform | Illumina [HiSeq 2000/2500] |
ライブラリソース | 腫瘍組織から抽出したgDNA |
検体情報(購入の場合) | - |
ライブラリ作製方法(キット名) | SureSelect Human All Exon Kit v4.0 (Agilent Technologies) |
断片化方法 | 超音波断片化(Covaris SS) |
ライブラリ構築方法 | Paired-end |
リード長(除:バーコード、アダプター、プライマー、リンカー) | 100 bp x 2 |
DDBJ Sequence Read Archive ID | DRA004251 |
総データ量 | 600 GB (fastq) |
コメント(利用にあたっての制限事項) | NBDC policy |
提供者情報
研究代表者: 谷内田 真一
所 属 機 関: 国立がん研究センター研究所・臨床ゲノミクス研究ユニット、大阪大学大学院 医学系研究科 医学部 ゲノム生物学講座 がんゲノム情報学
プロジェクト/研究グループ名:
URL: http://www.ncc.go.jp/jp/information/press_release_20160126.html
科研費/助成金(Research Project Number):
科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
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科学研究費助成事業 新学術領域研究 | システム生物学的アプローチによる希少がんの分子病態解明と臨床病態の予測 | 25134719 |
関連論文
タイトル | DOI | データID | |
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1 | Genomic Sequencing Identifies ELF3 as a Driver of Ampullary Carcinoma | doi: 10.1016/j.ccell.2015.12.012 | DRA004251 |
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