NBDC Research ID: hum0048.v1
研究内容の概要
目的： 国際多施設共同研究によって、ファーター乳頭部腫瘍の分子遺伝学的な特徴を明らかにし、治療法の開発に貢献する。
方法： イルミナHiSeq 2000および2500を使用し、60名のファーター乳頭部がんの全エクソン解析を実施。
対象： 臨床・病理的に診断されたファーター乳頭部腫瘍60症例（日本人28症例、米国人32症例）
| データID | 内容 | 制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|
| DRA004251 | NGS（Exome） | 非制限公開 | 2016/02/05 |
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分子データ
| 対象 | ファーター乳頭部がん：60症例（日本人28症例、米国人32症例） |
| 規模 | Exome |
| 対象領域（Target Captureの場合） | - |
| Platform | Illumina [HiSeq 2000/2500] |
| ライブラリソース | 腫瘍組織から抽出したgDNA |
| 検体情報（購入の場合） | - |
| ライブラリ作製方法（キット名） | SureSelect Human All Exon Kit v4.0 （Agilent Technologies） |
| 断片化方法 | 超音波断片化（Covaris SS） |
| ライブラリ構築方法 | Paired-end |
| リード長（除：バーコード、アダプター、プライマー、リンカー） | 100 bp x 2 |
| DDBJ Sequence Read Archive ID | DRA004251 |
| 総データ量 | 600 GB （fastq） |
| コメント（利用にあたっての制限事項） | NBDC policy |
提供者情報
研究代表者： 谷内田 真一
所 属 機 関： 国立がん研究センター研究所・臨床ゲノミクス研究ユニット、大阪大学大学院 医学系研究科 医学部 ゲノム生物学講座 がんゲノム情報学
プロジェクト/研究グループ名：
URL： http://www.ncc.go.jp/jp/information/press_release_20160126.html
科研費/助成金（Research Project Number）：
| 科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
|---|---|---|
| 科学研究費助成事業 新学術領域研究 | システム生物学的アプローチによる希少がんの分子病態解明と臨床病態の予測 | 25134719 |
関連論文
| タイトル | DOI | データID | |
|---|---|---|---|
| 1 | Genomic Sequencing Identifies ELF3 as a Driver of Ampullary Carcinoma | doi: 10.1016/j.ccell.2015.12.012 | DRA004251 |
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