NBDC Research ID: hum0442.v1

 

研究内容の概要

目的: 抗PD-1/PD-L1抗体治療を行う進行・再発非小細胞肺がん患者における、血中アミノ酸プロファイルによる予後判別モデル(多変量判別式)の性能検証

方法: RNAシークエンス解析

対象: 抗PD-1/PD-L1抗体治療開始前の進行・再発非小細胞肺がん 20症例

 

データID内容制限公開日
JGAS000675 NGS(RNA-seq) 制限公開(Type I) 2024/08/08

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分子データ

JGAS000675

対象

進行・再発非小細胞肺がん(ICD10:C349):20症例

      腫瘍組織(FFPE検体):20検体

規模 RNA-seq
対象領域(Target Captureの場合) -
Platform Illumina [NovaSeq 6000]
ライブラリソース 腫瘍組織から抽出したRNA
検体情報(購入の場合) -
ライブラリ作製方法(キット名) Smart Seq Stranded kit
断片化の方法 Nextera XT DNA Library Prep Kit
ライブラリ構築方法 Paired-end
リード長(除:バーコード、アダプタ、プライマー、リンカー) 150 bp x 2
Japanese Genotype-phenotype Archive Dataset ID JGAD000805
総データ量 116.8 GB(fastq)
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提供者情報

研究代表者:笹田 哲朗

所 属 機 関:神奈川県立がんセンター 臨床研究所 がんワクチン・免疫センター

プロジェクト/研究グループ名:アミノ酸プロファイルによるがん免疫微小環境の代謝リプログラミング評価とがん免疫治療患者層別化技術の開発

科研費/助成金(Research Project Number):

科研費・助成金名タイトル研究課題番号
日本医療研究開発機構(AMED) 次世代治療・診断実現のための創薬基盤技術開発事業 患者層別化マーカー探索技術の開発/医療ニーズの高い特定疾患・薬剤に対する患者層別化基盤技術の開発 JP19ae0101076

 

関連論文

タイトルDOIデータID
1 Multi-omics analysis-based clinical and functional significance of a novel prognostic and immunotherapeutic gene signature derived from amino acid metabolism pathways in lung adenocarcinoma JGAD000805

 

制限公開データの利用者一覧

研究代表者所属機関国・州名研究題目利用データID利用期間